62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2407 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  100 
 
 
302 aa  615  1e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  67.31 
 
 
308 aa  388  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  66.45 
 
 
307 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  63.06 
 
 
309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.75 
 
 
293 aa  343  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  35.69 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  34.62 
 
 
286 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.49 
 
 
284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  32.74 
 
 
295 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  25.49 
 
 
287 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  31.86 
 
 
283 aa  135  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  30.92 
 
 
299 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  35.82 
 
 
336 aa  129  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  30.5 
 
 
299 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.5 
 
 
285 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  30.65 
 
 
272 aa  123  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  29.59 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  25.57 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  26.92 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  25.97 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  27.51 
 
 
414 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.39 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.65 
 
 
334 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.4 
 
 
295 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  29.32 
 
 
312 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  27.83 
 
 
311 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.69 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.65 
 
 
313 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.65 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.82 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  25.78 
 
 
410 aa  90.1  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  30.96 
 
 
245 aa  90.1  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.3 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.94 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  28.03 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.91 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.22 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.22 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.97 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.61 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.61 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.61 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.94 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.15 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  21.76 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.61 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  22.12 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  23.94 
 
 
300 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.12 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.88 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.06 
 
 
251 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  23 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0775  HhH-GPD family protein  26.42 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  31.51 
 
 
217 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2950  HhH-GPD family protein  27.04 
 
 
300 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296829  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2800  alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
565 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2820  alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 
565 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1557  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 
565 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.486878  hitchhiker  0.00513105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0738  HhH-GPD  26.26 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00497967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2940  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 
565 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91789  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.96 
 
 
220 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  34.17 
 
 
219 aa  42.4  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>