73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1313 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  100 
 
 		 312 aa  651    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  52.61 
 
 		 287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  48.87 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  48.33 
 
 		 313 aa  311  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  46.58 
 
 		 312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  43.27 
 
 		 312 aa  291  7e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  45.1 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  30.71 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  30.12 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  28.85 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  27.78 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  29.41 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  28.28 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.19 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  28.14 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  27.59 
 
 		 414 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.65 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.78 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.64 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  28.75 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.72 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.33 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.33 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  25 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  25.47 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  25.71 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  22.83 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  28.71 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.8 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  24.26 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.23 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  38.32 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2505  putative transcription regulator protein  30.22 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0201165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  25.81 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.95 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  30.37 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  30.34 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  29.85 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.79 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3870  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  30.93 
 
 		 517 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3944  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  30.93 
 
 		 517 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445653  hitchhiker  0.00805865 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  23.27 
 
 		 410 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2326  alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 		 503 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4163  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 482 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.813535  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2773  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 491 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3856  DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  29.38 
 
 		 496 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26438  hitchhiker  0.00733732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4053  HhH-GPD family protein  25.91 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00420  DNA-3-methyladenine glycosylase II /DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase /Transcriptional regulator Ada  23.28 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0163249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4073  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 505 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  26.34 
 
 		 486 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  29.17 
 
 		 494 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5912  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  27.27 
 
 		 500 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.43 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0738  HhH-GPD  25.69 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00497967  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  52.63 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2361  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.17 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3006  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.17 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.538332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3087  alcohol dehydrogenase  24.24 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00020691  hitchhiker  0.00000000000128814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  50 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0992  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.87 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  25.17 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01963  hypothetical protein  28.17 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1573  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.17 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.33 
 
 		 270 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  23.42 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0385  hypothetical protein  31.52 
 
 		 137 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987546  normal  0.068144 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1589  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.17 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01974  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.17 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2209  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.17 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11344  Ada regulatory protein alkA  31.34 
 
 		 496 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.334528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>