95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3329 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  100 
 
 
295 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  59.73 
 
 
295 aa  358  7e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  47.35 
 
 
297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  48.18 
 
 
300 aa  252  6e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  42.19 
 
 
312 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  42.19 
 
 
312 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  43.17 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  37.32 
 
 
279 aa  183  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.86 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  36 
 
 
272 aa  168  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  33.46 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  34.05 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  35.19 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  31.73 
 
 
283 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  31.85 
 
 
287 aa  145  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.7 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  29.49 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.29 
 
 
307 aa  126  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.36 
 
 
306 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.15 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.67 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  28.67 
 
 
336 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.85 
 
 
302 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.77 
 
 
308 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  28.9 
 
 
414 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  31.28 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  28 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.33 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.57 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  23.65 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.49 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.07 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.54 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.07 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.67 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  27.12 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.54 
 
 
303 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  22.14 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.07 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.07 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.07 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.23 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.07 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.34 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.54 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  26.67 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.17 
 
 
230 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.7 
 
 
240 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  41.82 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  26.82 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.29 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  25.56 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2950  HhH-GPD family protein  31.97 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296829  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3412  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.7 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1250  hypothetical protein  22.45 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  23.86 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.76 
 
 
288 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.8 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  24.1 
 
 
223 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11344  Ada regulatory protein alkA  22.22 
 
 
496 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.334528  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  24.1 
 
 
223 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  30.43 
 
 
226 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2538  AlkA-like  25.61 
 
 
319 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000684088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3151  alcohol dehydrogenase  25.61 
 
 
319 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000306407  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  20.73 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  28.03 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3088  alcohol dehydrogenase  23.47 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000614886  hitchhiker  0.000862712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6507  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.61 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000337261  normal  0.0896284 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  26.47 
 
 
233 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3170  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000626479  decreased coverage  0.000000129498 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9330  predicted protein  34.34 
 
 
107 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  34.12 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.85 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1367  Ada metal-binding domain-containing protein  25.99 
 
 
503 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  31.33 
 
 
224 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0086  DNA-3-methyladenine glycosylase II  22.81 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00010571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  33.01 
 
 
224 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  25.57 
 
 
486 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  28.87 
 
 
222 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  25 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  21.26 
 
 
494 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3087  alcohol dehydrogenase  23.04 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00020691  hitchhiker  0.00000000000128814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  28.26 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  26.83 
 
 
292 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1665  HhH-GPD family protein  31.52 
 
 
247 aa  43.5  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3204  alcohol dehydrogenase  23 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  25.73 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4322  alcohol dehydrogenase  21.46 
 
 
495 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  30.21 
 
 
219 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4073  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 
505 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2835  DNA-3-methyladenine glycosylase II  23.39 
 
 
304 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406051  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  34.09 
 
 
223 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0116  DNA-3-methyladenine glycosylase II  23.39 
 
 
298 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00108548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3954  AlkA domain protein  22.86 
 
 
305 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0202431  normal  0.626285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>