69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0823 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  65.91 
 
 
308 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  66.45 
 
 
302 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  61.46 
 
 
309 aa  347  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.39 
 
 
293 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  38.26 
 
 
285 aa  172  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  36.86 
 
 
299 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  36.7 
 
 
283 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.68 
 
 
285 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  27.36 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  33.55 
 
 
286 aa  146  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  31.53 
 
 
295 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  29.11 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  29.11 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  31.53 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.18 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.63 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  30.43 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  29.73 
 
 
272 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  30 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.24 
 
 
300 aa  119  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  34 
 
 
336 aa  119  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  27.41 
 
 
414 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.31 
 
 
334 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.1 
 
 
306 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  27.92 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.54 
 
 
312 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.9 
 
 
312 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.03 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  33.16 
 
 
245 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  31.84 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  30.24 
 
 
410 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.14 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  30.3 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.2 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.83 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.66 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  28.4 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.57 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.05 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.05 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.05 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.04 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.05 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.44 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2950  HhH-GPD family protein  28.93 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296829  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  30.84 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.31 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  29.69 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  23.39 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.98 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.57 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
513 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  31.6 
 
 
486 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
489 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  35.53 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  32.17 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2940  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
565 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91789  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.9 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.69 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1557  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
565 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.486878  hitchhiker  0.00513105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2800  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
565 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  36.14 
 
 
202 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  30.61 
 
 
220 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  29.52 
 
 
217 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1742  HhH-GPD family protein  28.1 
 
 
198 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.480671  normal  0.468533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.52 
 
 
199 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  31.3 
 
 
217 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>