80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1405 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  100 
 
 		 313 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  48.33 
 
 		 312 aa  311  7.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  45.67 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  46.64 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  53.78 
 
 		 287 aa  275  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  42.43 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  43.97 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  32.53 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  30.15 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.39 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.52 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  27.55 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  28.38 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  25.32 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.07 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  27.92 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.62 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  26.71 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  26.35 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  25.72 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  26.03 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  27.55 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  27.52 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  29.2 
 
 		 414 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.54 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  22.88 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  23.82 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.33 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.42 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  26.36 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  25.87 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.53 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  26.81 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  28.11 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  25.86 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4053  HhH-GPD family protein  31.88 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01963  hypothetical protein  31.69 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01974  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  31.69 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.93 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1573  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  31.69 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  normal  0.876119 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1589  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.69 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2209  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  31.69 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0992  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  31.69 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2361  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  30.99 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.77 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3006  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  30.99 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.538332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2505  putative transcription regulator protein  28.78 
 
 		 490 aa  52.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0201165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  32.87 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  31.3 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  26.67 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  31.47 
 
 		 287 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.78 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  27.78 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2359  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  33.33 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2308  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  32.54 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  27.78 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2252  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  32.54 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1164  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  30.28 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2352  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  32.54 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  32.17 
 
 		 213 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2467  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  32.54 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  27.22 
 
 		 287 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  53.19 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2682  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  37.38 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3841  HhH-GPD family protein  28.67 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  26.67 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.81 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  50 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  29.51 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.72 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  29.1 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  27.2 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.21 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.04 
 
 		 222 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0783  HhH-GPD family protein  27.56 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  29.13 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2773  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 491 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.7 
 
 		 230 aa  43.5  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  29.69 
 
 		 218 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  27.94 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>