52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35111 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  100 
 
 
336 aa  702    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  46.34 
 
 
414 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  33.43 
 
 
410 aa  177  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  36.4 
 
 
245 aa  163  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  28.29 
 
 
286 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.03 
 
 
306 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  30.62 
 
 
299 aa  143  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  28.62 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  29.74 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  29.69 
 
 
309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.63 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  35.82 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.01 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  30.26 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  31.13 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  31.58 
 
 
279 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  33.56 
 
 
295 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  30.89 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  30.57 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.5 
 
 
293 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  33.67 
 
 
287 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  32.31 
 
 
272 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  26.92 
 
 
312 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.67 
 
 
295 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.94 
 
 
300 aa  105  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.98 
 
 
334 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32 
 
 
308 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.57 
 
 
312 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.75 
 
 
312 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  25.95 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  27.52 
 
 
313 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  24.84 
 
 
312 aa  89.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  26.64 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.74 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  25.31 
 
 
301 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  23.37 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  25.14 
 
 
212 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  23.04 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  25.28 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.81 
 
 
274 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.52 
 
 
270 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  23.43 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  22.64 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  25.14 
 
 
218 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.33 
 
 
232 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.53 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  40.43 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1583  hypothetical protein  31.52 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.601051  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  29.25 
 
 
219 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  42.55 
 
 
278 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  26 
 
 
233 aa  42.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>