More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2002 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 330 aa  663    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  75.16 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  77 
 
 		 305 aa  461  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  71.9 
 
 		 319 aa  448  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  72.2 
 
 		 306 aa  434  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  40.72 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  42.05 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  40.13 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  41.2 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  48.11 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  41.15 
 
 		 355 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  41.03 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  37.87 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  42.44 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  39.15 
 
 		 435 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  37.91 
 
 		 386 aa  159  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  39.58 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.71 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  33.45 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  35.05 
 
 		 278 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.59 
 
 		 360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  41.32 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  39.16 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  37.7 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  40.58 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  36.63 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  37.67 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  38.26 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  33.33 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 354 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  37.04 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  37.1 
 
 		 373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.76 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  36.12 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  33.33 
 
 		 281 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  35.56 
 
 		 278 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  34.67 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  38.08 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  33.92 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  36.73 
 
 		 291 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  39.44 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  38.16 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  35.04 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  37.07 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  36.82 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  40.82 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  41.94 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  38.72 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.03 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.03 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  35.19 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  35.69 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  38.89 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  39.68 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  36.7 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  37.8 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  37.45 
 
 		 351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  39.61 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  36.42 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  35.59 
 
 		 222 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.56 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  39.45 
 
 		 360 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  34.76 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  36.32 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.91 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  38.65 
 
 		 355 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  35.56 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0019  A/G-specific adenine glycosylase  39.04 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  35.18 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  36.99 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  36.99 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  37.68 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  38.8 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  38.49 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  38.8 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  38.8 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  37.98 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  35.89 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 407 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.51 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  40.76 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  32.64 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  39.67 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  38.46 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  36.52 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  35.89 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  39.11 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>