More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0967 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  100 
 
 
328 aa  660    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  58.36 
 
 
331 aa  358  7e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  48.01 
 
 
287 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  45.51 
 
 
291 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  42.46 
 
 
291 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  46.73 
 
 
285 aa  248  9e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  44.48 
 
 
296 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  45.25 
 
 
291 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  43.65 
 
 
311 aa  245  6.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  44.65 
 
 
293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  41.43 
 
 
299 aa  241  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  44.97 
 
 
315 aa  239  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  45.03 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  44.95 
 
 
313 aa  232  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  43.14 
 
 
288 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  40.81 
 
 
299 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  44.06 
 
 
307 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  41.32 
 
 
310 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  42.86 
 
 
300 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  43.67 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  43.65 
 
 
581 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  41.79 
 
 
347 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  41 
 
 
308 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  41.03 
 
 
300 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  42.32 
 
 
335 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  43.61 
 
 
311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  42.31 
 
 
303 aa  215  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  39.75 
 
 
329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  42.62 
 
 
303 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  41.01 
 
 
320 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  39.75 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  39.61 
 
 
288 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  39.61 
 
 
288 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  39.61 
 
 
288 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  38.39 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  42.9 
 
 
285 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  42.59 
 
 
300 aa  192  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  39.48 
 
 
290 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  44.16 
 
 
272 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  40.13 
 
 
291 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  36.8 
 
 
318 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  36.69 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  37.77 
 
 
309 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  33.8 
 
 
323 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  38.11 
 
 
369 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.87 
 
 
368 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  32.32 
 
 
373 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  33.71 
 
 
382 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  39.34 
 
 
370 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  38.87 
 
 
368 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.88 
 
 
375 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  38.87 
 
 
368 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  38.87 
 
 
368 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 
396 aa  155  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  36.8 
 
 
306 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  33.58 
 
 
381 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  38.55 
 
 
353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  38.71 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  34.26 
 
 
360 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  34.63 
 
 
305 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
368 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  35.77 
 
 
351 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  37.85 
 
 
368 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  37.85 
 
 
368 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  37.85 
 
 
368 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  37.85 
 
 
368 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  37.35 
 
 
367 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.83 
 
 
361 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  33.55 
 
 
388 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.15 
 
 
367 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  36.97 
 
 
350 aa  149  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  37.4 
 
 
615 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  34.77 
 
 
373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  35.69 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  34.22 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43811  predicted protein  38.1 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.22 
 
 
368 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  39.84 
 
 
392 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  32.43 
 
 
370 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.29 
 
 
363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  32.84 
 
 
365 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.21 
 
 
372 aa  146  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  37.02 
 
 
353 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  36.59 
 
 
401 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
362 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.84 
 
 
372 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  36.19 
 
 
357 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  31.37 
 
 
344 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.45 
 
 
345 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  32.54 
 
 
357 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.84 
 
 
372 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  32.94 
 
 
363 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  32.94 
 
 
363 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  31.17 
 
 
363 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  32.94 
 
 
363 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  32.94 
 
 
363 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  34.85 
 
 
360 aa  142  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  34.38 
 
 
381 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>