More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4708 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  88.59 
 
 		 299 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  58.42 
 
 		 291 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  60.9 
 
 		 291 aa  331  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  59.15 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  62.63 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  58.82 
 
 		 296 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  61.27 
 
 		 320 aa  318  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  61.07 
 
 		 307 aa  316  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  60.64 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  60.64 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  58.16 
 
 		 291 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  60.64 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  56.84 
 
 		 329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  57.45 
 
 		 293 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  60.28 
 
 		 290 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  61.97 
 
 		 291 aa  305  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  57.76 
 
 		 287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  57.84 
 
 		 303 aa  301  8.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  59.65 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  56.07 
 
 		 288 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  58.33 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  56.25 
 
 		 300 aa  298  8e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  56.74 
 
 		 304 aa  289  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  53.38 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  54.32 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  55.27 
 
 		 315 aa  268  8.999999999999999e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  55.84 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  52.3 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  50.85 
 
 		 313 aa  262  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  54.8 
 
 		 581 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  51.85 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  50 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  53.93 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  52.69 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  41.74 
 
 		 328 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  49.27 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  41.28 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  45.52 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  39.02 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  38.78 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  43.56 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  40.14 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  43.16 
 
 		 383 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  40.28 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  43.06 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  40.36 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  37.76 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.33 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.33 
 
 		 372 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  43.2 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  37.01 
 
 		 353 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  36.84 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  39.63 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  36.62 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  36.86 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  44.64 
 
 		 615 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.54 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.89 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.89 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.46 
 
 		 357 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  42.92 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.3 
 
 		 383 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  38.79 
 
 		 362 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.48 
 
 		 368 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  39.48 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  39.48 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  39.48 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.13 
 
 		 348 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  35.92 
 
 		 353 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  38.16 
 
 		 344 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  38.33 
 
 		 401 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  40.27 
 
 		 352 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  42.47 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.61 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  39.15 
 
 		 355 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  35.61 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  39.62 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  38.16 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  38.41 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.86 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.38 
 
 		 361 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.99 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 363 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 363 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 363 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  38.63 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  38.74 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  36.97 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  35.09 
 
 		 373 aa  142  8e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  37.77 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  38.91 
 
 		 356 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>