More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0177 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 347 aa  686    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  80 
 
 		 308 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  57.32 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  55.13 
 
 		 296 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  57.63 
 
 		 307 aa  311  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  56.4 
 
 		 291 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  56.06 
 
 		 291 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  54.22 
 
 		 288 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  54.72 
 
 		 287 aa  292  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  56.86 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  53.72 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  56.76 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  53.38 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  52.43 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  52.3 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  50.67 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  52.19 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  51.25 
 
 		 581 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  52.13 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  51.36 
 
 		 293 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  53.08 
 
 		 299 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  53.33 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  52.94 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  51.18 
 
 		 303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  50 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  48.04 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  47.18 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  47.62 
 
 		 300 aa  249  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  49.84 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  41.79 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  49.13 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  45.15 
 
 		 290 aa  228  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  51.46 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  45.67 
 
 		 288 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  45.67 
 
 		 288 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  45.67 
 
 		 288 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.73 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  45.61 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  41.91 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  37.85 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  41.73 
 
 		 317 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  39.07 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  37.07 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  40.58 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  39.26 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  38.74 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  42.52 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  39.23 
 
 		 308 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.13 
 
 		 383 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  42.36 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  38.05 
 
 		 388 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  41.59 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.01 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  38.39 
 
 		 341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  39.61 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  39.92 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.66 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.05 
 
 		 359 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  35.51 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  40.19 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.44 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  40.19 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.53 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  41.24 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  37.62 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  36.86 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  36.86 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  36.86 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  39.22 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.53 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  35.75 
 
 		 355 aa  142  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  39.17 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  41.15 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  38.73 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  36.54 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  36.08 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  29.77 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  36.68 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  29.77 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  36.44 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  36.13 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.2 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  33.79 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  35 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  36.68 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  36.68 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  34.6 
 
 		 347 aa  139  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  36.68 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  36.68 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>