More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0064 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 
345 aa  706    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  56.82 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  56.81 
 
 
368 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  56.81 
 
 
368 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  57.1 
 
 
368 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  56.81 
 
 
368 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  56.81 
 
 
368 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  56.81 
 
 
368 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  55.52 
 
 
369 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.94 
 
 
375 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  56.81 
 
 
368 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.36 
 
 
368 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  55.33 
 
 
370 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  55.36 
 
 
368 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  55.07 
 
 
368 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  57.31 
 
 
353 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  55.36 
 
 
368 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  56.23 
 
 
368 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  55.36 
 
 
359 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  55.65 
 
 
381 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  50.84 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.16 
 
 
344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.09 
 
 
368 aa  335  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  50.98 
 
 
362 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  50.44 
 
 
362 aa  332  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  44.13 
 
 
382 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  51.59 
 
 
382 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  46.86 
 
 
354 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  45.59 
 
 
370 aa  328  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.56 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  50.29 
 
 
382 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  48.55 
 
 
355 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  48.7 
 
 
355 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.7 
 
 
355 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  48.41 
 
 
355 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.25 
 
 
355 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.82 
 
 
372 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  47.81 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  45.13 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  45.13 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  44.84 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  45.13 
 
 
360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.8 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  45.13 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  42.69 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  45.13 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  47.11 
 
 
355 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  44.84 
 
 
360 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.17 
 
 
361 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  47.11 
 
 
355 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  44.54 
 
 
360 aa  319  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  44.84 
 
 
350 aa  319  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 
353 aa  318  7e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  42.82 
 
 
365 aa  318  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.99 
 
 
372 aa  318  9e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  44.74 
 
 
350 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  50.87 
 
 
355 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  43.66 
 
 
352 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  44.25 
 
 
350 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  44.25 
 
 
350 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0348  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.55 
 
 
393 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  44.25 
 
 
350 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  44.06 
 
 
368 aa  316  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.99 
 
 
372 aa  315  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  49.57 
 
 
374 aa  315  8e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  49.57 
 
 
355 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  43.95 
 
 
350 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0295  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.68 
 
 
405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  42.94 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  44.51 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  42.32 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  44.19 
 
 
355 aa  309  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  46.2 
 
 
354 aa  309  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  42.94 
 
 
357 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  42.61 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  43.07 
 
 
371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  42.32 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  41.31 
 
 
368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  42.49 
 
 
362 aa  305  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  40.73 
 
 
368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  43.14 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  48.97 
 
 
370 aa  301  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  43.32 
 
 
361 aa  301  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  42.37 
 
 
363 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  43.38 
 
 
363 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 
353 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 
363 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 
363 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  47.84 
 
 
357 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.24 
 
 
355 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  44.19 
 
 
350 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  47.38 
 
 
344 aa  296  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  42.73 
 
 
350 aa  295  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.41 
 
 
357 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.12 
 
 
368 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  42.77 
 
 
358 aa  295  8e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0376  A/G-specific adenine glycosylase  42.98 
 
 
358 aa  295  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.798144  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  44.6 
 
 
350 aa  295  9e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  45.4 
 
 
351 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  42.56 
 
 
363 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>