More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3307 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  99.71 
 
 		 350 aa  727    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  99.71 
 
 		 350 aa  727    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  86.93 
 
 		 352 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  90.86 
 
 		 350 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  100 
 
 		 360 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  99.71 
 
 		 350 aa  726    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  99.44 
 
 		 360 aa  744    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  98.86 
 
 		 350 aa  721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  90.86 
 
 		 350 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  99.71 
 
 		 350 aa  727    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  99.44 
 
 		 360 aa  745    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  90.86 
 
 		 350 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  90.86 
 
 		 350 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  99.71 
 
 		 350 aa  727    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  90.86 
 
 		 350 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  75.07 
 
 		 381 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  76.22 
 
 		 368 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  77.91 
 
 		 361 aa  557  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  75.87 
 
 		 371 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  75.14 
 
 		 419 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  74.5 
 
 		 368 aa  554  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  75.29 
 
 		 372 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  76.12 
 
 		 363 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  60.58 
 
 		 368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.31 
 
 		 372 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.36 
 
 		 372 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.75 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  60.82 
 
 		 368 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  58.33 
 
 		 365 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  58.75 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  57.14 
 
 		 354 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  59.42 
 
 		 357 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  60.23 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  57.77 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  59.48 
 
 		 353 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  57.93 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  58.33 
 
 		 363 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  57.76 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  57.76 
 
 		 363 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  58.05 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.94 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  58.29 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.81 
 
 		 353 aa  401  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  56.98 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  56.65 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  57.27 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  54.26 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0376  A/G-specific adenine glycosylase  54.94 
 
 		 358 aa  388  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.798144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.65 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  53.49 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  53.49 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  53.49 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  53.49 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  53.49 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  54.44 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  52.91 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  52.91 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.89 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.91 
 
 		 355 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  53.78 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  53.78 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  49.57 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.45 
 
 		 361 aa  348  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  50.73 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  50.29 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  51.01 
 
 		 354 aa  342  9e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  50.72 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.86 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.29 
 
 		 355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  46.55 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  46.65 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  46.88 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  45.95 
 
 		 355 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  45.95 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  44.01 
 
 		 368 aa  322  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  46.31 
 
 		 351 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  46.57 
 
 		 353 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.33 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.84 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.79 
 
 		 370 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  45.33 
 
 		 368 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  45.33 
 
 		 368 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  45.33 
 
 		 368 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 		 368 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 		 368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 		 368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.91 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  45.71 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  45.22 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  44.73 
 
 		 374 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.02 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  46.84 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01430  A/G-specific adenine glycosylase  45.92 
 
 		 357 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1056  A/G-specific adenine glycosylase  45.8 
 
 		 349 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.992561  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  44.76 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  44.76 
 
 		 381 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>