More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0903 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
386 aa  793    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  46.13 
 
 
374 aa  309  4e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  46.18 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  46.65 
 
 
365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  46.65 
 
 
365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  46.65 
 
 
365 aa  305  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  46.2 
 
 
365 aa  305  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  46.65 
 
 
365 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  46.65 
 
 
365 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  46.65 
 
 
365 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  46.33 
 
 
365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  46.33 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  46.33 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  43.07 
 
 
366 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  46.22 
 
 
383 aa  293  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  42.98 
 
 
366 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.89 
 
 
342 aa  291  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  43.48 
 
 
344 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  43.49 
 
 
347 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  47.86 
 
 
401 aa  262  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  42.53 
 
 
345 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  42.53 
 
 
345 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  43.87 
 
 
350 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.57 
 
 
383 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  44.62 
 
 
388 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  43.13 
 
 
373 aa  249  5e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  40.12 
 
 
355 aa  245  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  38.3 
 
 
335 aa  240  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  40.32 
 
 
381 aa  239  6.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  39.68 
 
 
407 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  37.92 
 
 
382 aa  236  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  40.86 
 
 
360 aa  235  8e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  40.19 
 
 
350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  42.81 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.08 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  41.57 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.91 
 
 
360 aa  233  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  44.85 
 
 
615 aa  232  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  38.14 
 
 
355 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.07 
 
 
363 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  41.7 
 
 
373 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  36.83 
 
 
352 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  40.14 
 
 
354 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  40.14 
 
 
354 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  36.62 
 
 
353 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  38.91 
 
 
358 aa  229  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  38.91 
 
 
330 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  38.51 
 
 
358 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.86 
 
 
355 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  42.8 
 
 
396 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.22 
 
 
367 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  37.23 
 
 
353 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  43.92 
 
 
464 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  43.18 
 
 
347 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  39.45 
 
 
355 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  39.78 
 
 
362 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.87 
 
 
357 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  39.05 
 
 
354 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  41 
 
 
349 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  43.87 
 
 
360 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  37.1 
 
 
352 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  36.73 
 
 
354 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  39.75 
 
 
350 aa  222  7e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  37.46 
 
 
354 aa  222  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  35.69 
 
 
384 aa  222  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  40.43 
 
 
350 aa  222  8e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  37.8 
 
 
352 aa  222  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  36.55 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  40.61 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  36.63 
 
 
355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  38.97 
 
 
415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.39 
 
 
357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  41.04 
 
 
371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  34.39 
 
 
357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  36.77 
 
 
352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.22 
 
 
374 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  37.38 
 
 
368 aa  219  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.42 
 
 
345 aa  219  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  39.93 
 
 
355 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  40.15 
 
 
367 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  34.23 
 
 
356 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.42 
 
 
367 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.21 
 
 
353 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  39.09 
 
 
358 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  37.88 
 
 
381 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.07 
 
 
355 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  39.08 
 
 
435 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  35.73 
 
 
368 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  34.51 
 
 
388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  42.97 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  38.83 
 
 
358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.23 
 
 
363 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.1 
 
 
372 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.98 
 
 
372 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.46 
 
 
344 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 
350 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  37.74 
 
 
365 aa  215  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  35.54 
 
 
367 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41 
 
 
368 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  38.75 
 
 
376 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>