More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2032 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 354 aa  705    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  57.1 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.84 
 
 		 359 aa  342  7e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  51.69 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  56.16 
 
 		 355 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  54.26 
 
 		 383 aa  322  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  50.86 
 
 		 358 aa  322  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  53.31 
 
 		 464 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  50.86 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  53.89 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.89 
 
 		 367 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  51.97 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  52.11 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  52.89 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  53.33 
 
 		 405 aa  315  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  52.31 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.98 
 
 		 374 aa  312  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  52.46 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  53.47 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  54.62 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.18 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  49.15 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  50.14 
 
 		 370 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  53.31 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  53.91 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 		 350 aa  298  7e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  54.31 
 
 		 376 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  52.45 
 
 		 349 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  48.5 
 
 		 615 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  48.79 
 
 		 415 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  50.41 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  51.99 
 
 		 328 aa  288  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.86 
 
 		 353 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 		 369 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.11 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.85 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.15 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.97 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  54.17 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  48.56 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  50.44 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  38.8 
 
 		 386 aa  237  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  41.29 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  38.59 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  45.45 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  38.59 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  39.75 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  36.36 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.45 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  44.62 
 
 		 386 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  44.23 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  43.32 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  40.62 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  44.23 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  36.84 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  36.95 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  36.68 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.46 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.64 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  40.31 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  38.87 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.22 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  44.62 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  36.89 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  45.42 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  38.56 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.23 
 
 		 355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  40.17 
 
 		 374 aa  216  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  41.97 
 
 		 368 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  41.97 
 
 		 368 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  41.69 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  38.72 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  39.05 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  44.79 
 
 		 362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  39.45 
 
 		 384 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  38.11 
 
 		 355 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  41.35 
 
 		 360 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  41.29 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  41.29 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  41.29 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  41.29 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  38.56 
 
 		 401 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  38.6 
 
 		 353 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  42.49 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  40.97 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  40.71 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  41.21 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.13 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  41.16 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  41.16 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  41.03 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  41.21 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>