More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2605 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  100 
 
 		 415 aa  838    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  82.71 
 
 		 392 aa  581  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  73.14 
 
 		 367 aa  531  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  70.18 
 
 		 371 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  69.21 
 
 		 376 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  70.37 
 
 		 349 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  68.87 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  53.57 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  56.18 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  56.18 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  57.22 
 
 		 405 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  54.47 
 
 		 404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  57.26 
 
 		 405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  55.82 
 
 		 355 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  53.26 
 
 		 359 aa  345  8e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.57 
 
 		 374 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  49.74 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  52.97 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  49.48 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  51.16 
 
 		 615 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  50.52 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  49.34 
 
 		 367 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  48.56 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  49.34 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.33 
 
 		 350 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  47.12 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  46.92 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.82 
 
 		 344 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  47.67 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.67 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  49.33 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.46 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.76 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  46.09 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  47.66 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  47.03 
 
 		 369 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.17 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  45.43 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  47.06 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  49.11 
 
 		 350 aa  253  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.82 
 
 		 353 aa  252  9.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  39.78 
 
 		 352 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.02 
 
 		 368 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.94 
 
 		 375 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  36.67 
 
 		 383 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  39.69 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  40.16 
 
 		 369 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  40.55 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  38.97 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  40.21 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  40.55 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  40.55 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  39.53 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39.53 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  39.53 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  44.56 
 
 		 382 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  36.7 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.39 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  37.27 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.87 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  38.74 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  38.86 
 
 		 350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  38.86 
 
 		 350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  38.74 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  38.86 
 
 		 350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  38.86 
 
 		 350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  38.44 
 
 		 360 aa  217  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  38.44 
 
 		 350 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34.95 
 
 		 352 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.06 
 
 		 348 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  39.84 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  33.67 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  37.16 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  37.94 
 
 		 350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.74 
 
 		 345 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  32.07 
 
 		 345 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  33.87 
 
 		 355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  34.95 
 
 		 352 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  32.07 
 
 		 345 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  34.18 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  33.77 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  35.73 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  35.96 
 
 		 355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  34.22 
 
 		 350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  33.59 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  36.22 
 
 		 374 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  37.28 
 
 		 350 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  37.83 
 
 		 354 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  36.93 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  33.9 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  37.17 
 
 		 350 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  36.67 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  37.17 
 
 		 350 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  34.4 
 
 		 363 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  37.28 
 
 		 350 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>