More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6939 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
405 aa  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  87.16 
 
 
405 aa  630  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  79.49 
 
 
441 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  79.24 
 
 
441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  79.44 
 
 
404 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  76.71 
 
 
464 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  62.79 
 
 
349 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  61.36 
 
 
367 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  59.78 
 
 
371 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  60.69 
 
 
355 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  59.26 
 
 
376 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  60.81 
 
 
374 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  57.22 
 
 
392 aa  362  9e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  59.6 
 
 
357 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  57.26 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  60.06 
 
 
359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  56.4 
 
 
358 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  56.1 
 
 
358 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  54.39 
 
 
388 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  57.62 
 
 
615 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  54.39 
 
 
364 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  56.29 
 
 
365 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  57.99 
 
 
383 aa  342  7e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.99 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  54.7 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  55.4 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  56.18 
 
 
370 aa  336  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  52.99 
 
 
347 aa  319  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  55.83 
 
 
328 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  54.62 
 
 
354 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  54.25 
 
 
369 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55 
 
 
359 aa  315  7e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.46 
 
 
353 aa  313  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.05 
 
 
350 aa  313  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  44.96 
 
 
350 aa  297  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.3 
 
 
345 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.14 
 
 
359 aa  296  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.88 
 
 
344 aa  296  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  54.55 
 
 
364 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  53.04 
 
 
333 aa  280  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  53.87 
 
 
350 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  47.81 
 
 
352 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  38.86 
 
 
364 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  37.57 
 
 
365 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  38.29 
 
 
365 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  38.29 
 
 
365 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  38.29 
 
 
365 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  38.29 
 
 
365 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  37.85 
 
 
365 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  37.57 
 
 
365 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  38.29 
 
 
365 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  37.43 
 
 
365 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  38 
 
 
365 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.84 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  40.8 
 
 
366 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  42.49 
 
 
355 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  38.95 
 
 
363 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  36.6 
 
 
351 aa  236  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  42.81 
 
 
355 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.08 
 
 
352 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  47.27 
 
 
330 aa  236  8e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 
386 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.08 
 
 
352 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  38.35 
 
 
354 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  38.35 
 
 
354 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  44.09 
 
 
374 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  37.1 
 
 
373 aa  230  3e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.38 
 
 
370 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.63 
 
 
368 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  37.68 
 
 
366 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.13 
 
 
383 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 
368 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.39 
 
 
360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.45 
 
 
353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 
368 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.63 
 
 
368 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2284  A/G-specific adenine glycosylase  44.83 
 
 
453 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  46.15 
 
 
368 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  46.01 
 
 
368 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  46.01 
 
 
368 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  46.15 
 
 
368 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  46.01 
 
 
368 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  46.15 
 
 
368 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  46.01 
 
 
368 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  45.69 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.36 
 
 
355 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  42.25 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  38.37 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1851  A/G-specific adenine glycosylase  48.2 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.641505  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  43.73 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  44.52 
 
 
355 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  42 
 
 
369 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1984  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.44 
 
 
453 aa  219  5e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.328101  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  44.52 
 
 
355 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  38.33 
 
 
350 aa  219  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.61 
 
 
368 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.86 
 
 
375 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  35.94 
 
 
354 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  42.45 
 
 
351 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  45.28 
 
 
353 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>