More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1502 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  100 
 
 
347 aa  690    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  57.39 
 
 
354 aa  357  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.02 
 
 
367 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  51.73 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  53.76 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  53.71 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  51.99 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  51.3 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  51.3 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.73 
 
 
353 aa  305  7e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  51.7 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  51.15 
 
 
464 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  52.33 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  48.02 
 
 
388 aa  302  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.34 
 
 
345 aa  301  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.33 
 
 
350 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  54.43 
 
 
328 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.44 
 
 
374 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  49.3 
 
 
365 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  48.87 
 
 
364 aa  295  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.02 
 
 
367 aa  295  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 
371 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.32 
 
 
359 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  52.45 
 
 
404 aa  291  9e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  49.86 
 
 
392 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.15 
 
 
344 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  48.73 
 
 
367 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.87 
 
 
359 aa  286  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  51.58 
 
 
355 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  48.89 
 
 
383 aa  285  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  49.44 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  50.29 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  48.25 
 
 
415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  53.76 
 
 
364 aa  281  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  50.28 
 
 
615 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  48.7 
 
 
357 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  49.56 
 
 
359 aa  275  9e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  50.33 
 
 
370 aa  272  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  43.57 
 
 
350 aa  259  4e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  49.14 
 
 
350 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  52.65 
 
 
333 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  40.57 
 
 
355 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  39.61 
 
 
386 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.88 
 
 
355 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  35.54 
 
 
345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  41.59 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  41.21 
 
 
363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  35.54 
 
 
345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1984  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.39 
 
 
453 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.328101  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.17 
 
 
355 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.8 
 
 
353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  38.77 
 
 
350 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  39.25 
 
 
384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2284  A/G-specific adenine glycosylase  42.39 
 
 
453 aa  215  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 
383 aa  215  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.18 
 
 
368 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 
368 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  42.55 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  41.76 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  39.63 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  39.94 
 
 
366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.31 
 
 
375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  39.63 
 
 
352 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.84 
 
 
360 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  42.52 
 
 
355 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42 
 
 
357 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.5 
 
 
368 aa  210  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  37.54 
 
 
354 aa  209  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 
368 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 
368 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 
368 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  37.54 
 
 
354 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 
368 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 
368 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.99 
 
 
357 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 
368 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  43.59 
 
 
330 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 
368 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 
347 aa  209  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1851  A/G-specific adenine glycosylase  46.51 
 
 
381 aa  208  9e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.641505  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  37.06 
 
 
364 aa  208  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  41.99 
 
 
357 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.98 
 
 
355 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  39.38 
 
 
360 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  38.35 
 
 
369 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  40.38 
 
 
419 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  39.24 
 
 
355 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  43.49 
 
 
352 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  39.75 
 
 
353 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  33.71 
 
 
351 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  38.41 
 
 
350 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  37.57 
 
 
374 aa  206  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  39.43 
 
 
360 aa  205  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  41.2 
 
 
355 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  40.86 
 
 
355 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  39.75 
 
 
372 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  35.99 
 
 
365 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>