More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3251 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 		 359 aa  718    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  59.05 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  53.82 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  55.84 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.44 
 
 		 367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  53.65 
 
 		 615 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  54.15 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  54.37 
 
 		 365 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  54.25 
 
 		 359 aa  332  8e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  53.26 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.68 
 
 		 345 aa  326  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.85 
 
 		 374 aa  326  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.34 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  53.73 
 
 		 383 aa  322  9.000000000000001e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.3 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  54.41 
 
 		 441 aa  316  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  51.8 
 
 		 369 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  52.07 
 
 		 370 aa  315  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  54.55 
 
 		 404 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  50.44 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  50.44 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  54.41 
 
 		 441 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  51.48 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.79 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.72 
 
 		 350 aa  309  5.9999999999999995e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  54.31 
 
 		 376 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  55 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  55.41 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  53.43 
 
 		 405 aa  305  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  50.58 
 
 		 364 aa  305  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  53.37 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  53.12 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  53.33 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.09 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  51.25 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  55.72 
 
 		 364 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  49.46 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  52.65 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  43.8 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  52.34 
 
 		 333 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  51.74 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  45.67 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  43.54 
 
 		 350 aa  252  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.76 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  43.54 
 
 		 360 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  43.54 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  43.54 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  43.24 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  43.54 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  43.24 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  43.54 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  43.54 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  44.83 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.41 
 
 		 375 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  45.78 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  45.93 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  45.93 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  43.59 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  44.95 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  44.95 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  44.95 
 
 		 350 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  43.29 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  43.22 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.29 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  43.29 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  43.29 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  43.29 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  43.29 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  43.29 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  42.55 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  43.29 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  42.55 
 
 		 368 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  42.55 
 
 		 368 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  44.81 
 
 		 368 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40.11 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  40.19 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  44.66 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  40.19 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 369 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  38.76 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  45.31 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  43.31 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  39 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  38.6 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.98 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  40.76 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  42.99 
 
 		 371 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  38.95 
 
 		 355 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  42.69 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  42.69 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.44 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.72 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  41.16 
 
 		 384 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  43.19 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.12 
 
 		 345 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  44.33 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  45.36 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  43.03 
 
 		 355 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  41.32 
 
 		 374 aa  229  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>