More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2097 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 328 aa  654    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  65.81 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  65.16 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  64.19 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  63.01 
 
 		 345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  63.43 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  66.88 
 
 		 364 aa  322  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.66 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  56.63 
 
 		 405 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.27 
 
 		 374 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  54.21 
 
 		 388 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  58.07 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  55.18 
 
 		 370 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  52.11 
 
 		 464 aa  305  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  55 
 
 		 615 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  53.48 
 
 		 441 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  55.31 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  53.48 
 
 		 441 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  56.37 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.54 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  54.57 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.41 
 
 		 359 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  52.04 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  52.04 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  53.5 
 
 		 404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  52.27 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  56.49 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.28 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  51.27 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.52 
 
 		 367 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  54.49 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  53.11 
 
 		 347 aa  279  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  51.99 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  52.35 
 
 		 349 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  52.53 
 
 		 371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  52.16 
 
 		 376 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  50.31 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  49.85 
 
 		 392 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  47.38 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  44.41 
 
 		 350 aa  252  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  53.23 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  42.94 
 
 		 352 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  38.87 
 
 		 355 aa  215  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  39.5 
 
 		 355 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 386 aa  210  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.15 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  40.14 
 
 		 353 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.49 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  37.96 
 
 		 366 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.41 
 
 		 348 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.04 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  38.18 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  43.97 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  40.07 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  41.24 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.01 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  41.47 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  41.47 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  41.47 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  41.47 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  41.47 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.41 
 
 		 354 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  44.27 
 
 		 359 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  41.14 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  40.8 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  38.59 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.95 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1984  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.7 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.328101  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  40.8 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  41.02 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.61 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  40.8 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  41.02 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  41.02 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.01 
 
 		 357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  43.29 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.72 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  37.07 
 
 		 352 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  37.25 
 
 		 365 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  37.25 
 
 		 365 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  41.2 
 
 		 350 aa  198  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  37.25 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  37.25 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  37.25 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  37.25 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.62 
 
 		 375 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2284  A/G-specific adenine glycosylase  46.86 
 
 		 453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  36.58 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.79 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  41.19 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  40.34 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  40.99 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  39.66 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>