More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1466 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 		 367 aa  726    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  98.64 
 
 		 367 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  84.24 
 
 		 369 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  60.86 
 
 		 345 aa  398  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  68.05 
 
 		 364 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.77 
 
 		 353 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  65.16 
 
 		 328 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.16 
 
 		 374 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  54.05 
 
 		 388 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  56.13 
 
 		 615 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  53.39 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  52.6 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  52.31 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  56.52 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  53.57 
 
 		 370 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  53.85 
 
 		 464 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  56.48 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  55.56 
 
 		 405 aa  335  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  56.14 
 
 		 359 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  56.07 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.44 
 
 		 359 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  52.49 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  54.99 
 
 		 405 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  52.79 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.46 
 
 		 350 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.46 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  52.2 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  45.64 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.52 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  51.68 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  57.06 
 
 		 333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  53.89 
 
 		 354 aa  305  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  52.49 
 
 		 371 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  52.02 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.6 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  56.01 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  51.12 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  51.17 
 
 		 349 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  52.29 
 
 		 376 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  49.72 
 
 		 392 aa  288  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  47.41 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.27 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.73 
 
 		 368 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.73 
 
 		 368 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.73 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  41.1 
 
 		 354 aa  240  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.41 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  46.73 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.18 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.64 
 
 		 355 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  46.73 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  45.7 
 
 		 368 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  46.73 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.41 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  41.51 
 
 		 353 aa  236  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  46.42 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  44.24 
 
 		 369 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  46.42 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  46.42 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  46.42 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  42.77 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  36.92 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.6 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  42.38 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  41.52 
 
 		 350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  42.45 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  43.03 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.82 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  39.81 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  41.5 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  37.5 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  42.59 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.37 
 
 		 372 aa  228  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  41.96 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  41.01 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.37 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  41.85 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  41.64 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  41.46 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  43.09 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  43.09 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  43.09 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.68 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.19 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  43.09 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  43.09 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.85 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  42.77 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  42.77 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  42.66 
 
 		 382 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.43 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  42.44 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01430  A/G-specific adenine glycosylase  43.77 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.94 
 
 		 363 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  39.75 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  40.31 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  41.32 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  42.12 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  40.68 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>