More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1172 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
355 aa  701    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  62.64 
 
 
367 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  60.06 
 
 
388 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  61.81 
 
 
349 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  62.11 
 
 
376 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  61.4 
 
 
374 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  63.02 
 
 
359 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  60.87 
 
 
357 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  60.28 
 
 
371 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  57.53 
 
 
392 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  57.83 
 
 
464 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  61.11 
 
 
405 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  59.65 
 
 
441 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  59.24 
 
 
383 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  58.82 
 
 
615 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  56.85 
 
 
358 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  57.14 
 
 
358 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  59.06 
 
 
441 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  60.87 
 
 
405 aa  359  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  59.77 
 
 
404 aa  359  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  57.51 
 
 
367 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  55.82 
 
 
415 aa  355  5e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  53.95 
 
 
364 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  55.93 
 
 
365 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.05 
 
 
359 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  56.07 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.07 
 
 
367 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  54.67 
 
 
370 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.04 
 
 
350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  56.14 
 
 
369 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  56.16 
 
 
354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.8 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  58.07 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.33 
 
 
345 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.4 
 
 
344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  46.65 
 
 
350 aa  305  6e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.25 
 
 
359 aa  292  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  55.79 
 
 
364 aa  288  9e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  53.51 
 
 
333 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  51.87 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  50.14 
 
 
347 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.57 
 
 
383 aa  250  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  45.43 
 
 
352 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  39.93 
 
 
386 aa  233  5e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.13 
 
 
348 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.49 
 
 
352 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.26 
 
 
363 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.79 
 
 
353 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.16 
 
 
352 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  38.31 
 
 
360 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.33 
 
 
360 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  37.87 
 
 
364 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  40.23 
 
 
374 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  41.45 
 
 
362 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  47.35 
 
 
382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  40.43 
 
 
366 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  36.49 
 
 
350 aa  222  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  37.39 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  43.21 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.83 
 
 
355 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  35.82 
 
 
365 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  35.82 
 
 
365 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  35.82 
 
 
365 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  35.82 
 
 
365 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 
368 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  40.17 
 
 
353 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  35.82 
 
 
365 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  38.17 
 
 
355 aa  218  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  37.28 
 
 
355 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  35.99 
 
 
365 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01430  A/G-specific adenine glycosylase  42.2 
 
 
357 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.16 
 
 
355 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  40.69 
 
 
361 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  41.99 
 
 
355 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 
354 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  35.22 
 
 
365 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  35.82 
 
 
365 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  45.77 
 
 
368 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  39.5 
 
 
344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  43.72 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  36.18 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  36.34 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  36.01 
 
 
365 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  41.5 
 
 
355 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.77 
 
 
375 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  42.3 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  42.3 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  42.3 
 
 
360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  41 
 
 
324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  42.3 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  42.3 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  41.97 
 
 
360 aa  215  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  35.76 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  40.62 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  41.64 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  41.64 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.76 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  40.98 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.86 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  41.31 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>