More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3686 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 355 aa  741    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  48.66 
 
 		 335 aa  329  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  49.58 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  47.44 
 
 		 344 aa  322  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  45.81 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  48.45 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  45.58 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  45.57 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  45.45 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  44.25 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  45.45 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  38.57 
 
 		 369 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  40.12 
 
 		 386 aa  245  8e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.18 
 
 		 375 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  39.39 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  36.58 
 
 		 365 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  37.46 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  44.62 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  38.42 
 
 		 368 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.77 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  39.08 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  39.08 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  39.08 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  37.57 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.44 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  35.69 
 
 		 365 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  35.69 
 
 		 365 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  35.99 
 
 		 365 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  35.4 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  35.69 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  35.4 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  35.47 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  36.26 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  35.1 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  39.03 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  36.41 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  39.35 
 
 		 345 aa  225  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  39.35 
 
 		 345 aa  225  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.62 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  39.53 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  40.4 
 
 		 330 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  39.44 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  44.36 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.3 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  39.44 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  37.58 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  43.98 
 
 		 381 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  36.42 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  38.76 
 
 		 350 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  37.86 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  39.86 
 
 		 374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  42.59 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3492  A/G-specific adenine glycosylase  37.16 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000130303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  37.69 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  37.84 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  39.38 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.25 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  36.25 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  39.22 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  44.92 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  34.6 
 
 		 383 aa  209  9e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  33.62 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  37.22 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  35.98 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  34.87 
 
 		 615 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2284  A/G-specific adenine glycosylase  37.7 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  35.02 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  38.21 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  37.95 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  37.26 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  35.99 
 
 		 355 aa  206  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.26 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.58 
 
 		 367 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  35.22 
 
 		 350 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  35.25 
 
 		 361 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  35.22 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  35.22 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.91 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  40.91 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  36.08 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  37.63 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  36.83 
 
 		 388 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  39.11 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  43.72 
 
 		 355 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  41.47 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  41.63 
 
 		 349 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.62 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  36.22 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  34.88 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.02 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>