More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0980 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 350 aa  729    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  54.57 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  55 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  51.14 
 
 		 335 aa  325  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  48.01 
 
 		 373 aa  322  7e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  50.47 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  46.53 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  45.57 
 
 		 355 aa  295  6e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  46.01 
 
 		 407 aa  289  6e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  46.27 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  43.01 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  45.85 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  40.43 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  41.5 
 
 		 347 aa  228  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  39.41 
 
 		 384 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  43.41 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  43.41 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  43.51 
 
 		 401 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  39.58 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  39.58 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  39.33 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 		 386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  38.99 
 
 		 364 aa  222  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  38.95 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  42.25 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  39.52 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  43.7 
 
 		 355 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.95 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  43.7 
 
 		 355 aa  218  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  43.58 
 
 		 366 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.27 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  41.57 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  43.13 
 
 		 358 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  39.43 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.05 
 
 		 357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  43.13 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  40.54 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  40.54 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  40.54 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.89 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.97 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  39.24 
 
 		 356 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.64 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.54 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  42.35 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  37.42 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  39.47 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  41.38 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  42.47 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.85 
 
 		 368 aa  209  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.2 
 
 		 368 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  42.47 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  41.96 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  42.08 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  41.96 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.47 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  41.96 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  41.96 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  41.96 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  41.96 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  41.96 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  41.96 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  39.53 
 
 		 353 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  42.08 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  38.42 
 
 		 381 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  40.21 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  41.89 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  40.15 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  35.8 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  39.02 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  42.75 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3492  A/G-specific adenine glycosylase  40.54 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000130303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  38.41 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.08 
 
 		 374 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 353 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  36.96 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  37.29 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.76 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  38.11 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  39.12 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.54 
 
 		 345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  39.12 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  39.12 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  39.12 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39.12 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  40.22 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>