More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1299 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 		 357 aa  728    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  80.52 
 
 		 384 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  63.9 
 
 		 344 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  65.99 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  65.41 
 
 		 357 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  60.34 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  60 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  61.69 
 
 		 356 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  58.64 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.75 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3492  A/G-specific adenine glycosylase  53.7 
 
 		 384 aa  342  8e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000130303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  50.28 
 
 		 369 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.14 
 
 		 375 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  50.14 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  49.28 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  49.28 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  48.99 
 
 		 368 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.7 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  48.55 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  48.84 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  48.55 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  48.55 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  48.55 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  48.55 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  48.55 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  48.55 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  48.55 
 
 		 368 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  46.22 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  46.32 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  43.27 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.79 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  49.42 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  49.42 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  43.84 
 
 		 350 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  44.41 
 
 		 350 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  44.13 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  46.22 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  44.41 
 
 		 360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  44.41 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  44.41 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  44.41 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  43.27 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  44.13 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  43.55 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  44.41 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  44.41 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.61 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  44.13 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  43.55 
 
 		 350 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  45.89 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  46.05 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  45 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  42.45 
 
 		 350 aa  279  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  45.87 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  45.27 
 
 		 353 aa  278  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.89 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  41.88 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  44.25 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.15 
 
 		 368 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  44.25 
 
 		 355 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.07 
 
 		 355 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  44.99 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  44.7 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  45.71 
 
 		 355 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  42.05 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  47.41 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  41.11 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  42.94 
 
 		 361 aa  269  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  42.17 
 
 		 381 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.72 
 
 		 372 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 		 358 aa  268  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  46.79 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.63 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.44 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.77 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  41.64 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  41.91 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 		 368 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  40.86 
 
 		 368 aa  265  8.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  41.95 
 
 		 363 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  42.32 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  42.29 
 
 		 419 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  41.95 
 
 		 355 aa  262  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  40.29 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0348  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.05 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  42.17 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  47.03 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  41.26 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  50.36 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  41.26 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.52 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.68 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0295  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.36 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  41.53 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  41.04 
 
 		 370 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 357 aa  255  9e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  39.5 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  39.71 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>