More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0830 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  98.6 
 
 
357 aa  712    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
357 aa  723    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  70.61 
 
 
363 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  69.03 
 
 
356 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  64.76 
 
 
370 aa  441  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  65.41 
 
 
357 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  62.79 
 
 
353 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  62.57 
 
 
384 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  60.93 
 
 
344 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.99 
 
 
368 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.58 
 
 
375 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  50.14 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  52.6 
 
 
368 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  52.6 
 
 
368 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  52.6 
 
 
368 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.02 
 
 
368 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  51.86 
 
 
353 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 
368 aa  326  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 
370 aa  325  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3492  A/G-specific adenine glycosylase  51.85 
 
 
384 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000130303 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 
368 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 
368 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 
368 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 
368 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 
368 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 
368 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  50.43 
 
 
368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  52.6 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  52.6 
 
 
368 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  49.72 
 
 
362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  48.02 
 
 
383 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  43.75 
 
 
353 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  48.59 
 
 
362 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  48.63 
 
 
382 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.84 
 
 
345 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  47.67 
 
 
382 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  46.02 
 
 
355 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.25 
 
 
355 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  44.16 
 
 
371 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  43.5 
 
 
368 aa  289  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  45.27 
 
 
381 aa  289  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  44.16 
 
 
419 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.29 
 
 
344 aa  288  8e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  44.03 
 
 
368 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  42.3 
 
 
354 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  44.86 
 
 
355 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  43.59 
 
 
372 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.41 
 
 
372 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.52 
 
 
353 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  43.14 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  43.14 
 
 
368 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 
355 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  44.7 
 
 
350 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 
355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  44.41 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  45.04 
 
 
355 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  44.41 
 
 
350 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.58 
 
 
372 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  44 
 
 
350 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  44.13 
 
 
350 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.58 
 
 
372 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.84 
 
 
355 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  42.11 
 
 
362 aa  278  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  45.04 
 
 
355 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  40.92 
 
 
382 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 
350 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  48.68 
 
 
355 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  42.69 
 
 
350 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  41.86 
 
 
370 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  42.54 
 
 
363 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  42.27 
 
 
361 aa  275  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  41.24 
 
 
352 aa  275  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  42.86 
 
 
350 aa  275  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  41.83 
 
 
363 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  42.86 
 
 
360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  42.57 
 
 
360 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  42.86 
 
 
360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  40.34 
 
 
368 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  42.86 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  42.86 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  42.86 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  42.82 
 
 
363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  43.55 
 
 
354 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  42.38 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  42.38 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  42.25 
 
 
358 aa  271  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  42.45 
 
 
350 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  49.71 
 
 
355 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1141  A/G-specific adenine glycosylase  47.71 
 
 
358 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 
358 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  40.23 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  47.46 
 
 
359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  40.62 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  46.09 
 
 
374 aa  266  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  42.45 
 
 
354 aa  265  7e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  42.45 
 
 
354 aa  265  8e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.71 
 
 
355 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  43.42 
 
 
354 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.46 
 
 
370 aa  264  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>