More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3350 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  90.57 
 
 
350 aa  672    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  90.57 
 
 
350 aa  672    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  90.57 
 
 
350 aa  672    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  99.71 
 
 
350 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  99.14 
 
 
350 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  90 
 
 
350 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  98.86 
 
 
350 aa  720    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  100 
 
 
350 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  90.57 
 
 
350 aa  672    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  90.86 
 
 
360 aa  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  90.57 
 
 
350 aa  672    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  90.57 
 
 
360 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  90.57 
 
 
360 aa  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  99.43 
 
 
350 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  83.71 
 
 
352 aa  627  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  76.5 
 
 
381 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  75.93 
 
 
368 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  75.07 
 
 
368 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  77.61 
 
 
361 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  74.42 
 
 
371 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  73.84 
 
 
372 aa  548  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  76.42 
 
 
363 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  74.13 
 
 
419 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  57.97 
 
 
368 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  59.94 
 
 
368 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  57.14 
 
 
354 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.94 
 
 
372 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.9 
 
 
372 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.34 
 
 
372 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  56.9 
 
 
365 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  57.57 
 
 
370 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  59.13 
 
 
357 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  59.94 
 
 
350 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  56.01 
 
 
382 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  58.02 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  55.91 
 
 
362 aa  408  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  56.32 
 
 
363 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  58.29 
 
 
358 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.1 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  56.98 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  55.75 
 
 
363 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  55.75 
 
 
363 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  56.03 
 
 
363 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  56.98 
 
 
358 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.75 
 
 
353 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  53.62 
 
 
354 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  54.29 
 
 
357 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0376  A/G-specific adenine glycosylase  53.78 
 
 
358 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.798144  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.36 
 
 
355 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  53.2 
 
 
355 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  53.2 
 
 
355 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  53.2 
 
 
355 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  53.2 
 
 
355 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  53.2 
 
 
355 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  52.91 
 
 
355 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.91 
 
 
355 aa  355  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  51.86 
 
 
362 aa  355  6.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  53.03 
 
 
362 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  51.3 
 
 
354 aa  353  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.45 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  53.49 
 
 
355 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 
350 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  52.62 
 
 
355 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.16 
 
 
361 aa  342  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  49.86 
 
 
354 aa  342  7e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  49.86 
 
 
354 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  50.15 
 
 
353 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.16 
 
 
355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.74 
 
 
375 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  46.94 
 
 
359 aa  328  7e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  47.7 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  45.4 
 
 
369 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  47.65 
 
 
351 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  45.09 
 
 
355 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  45.09 
 
 
355 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  46.74 
 
 
353 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.83 
 
 
370 aa  315  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.29 
 
 
368 aa  315  6e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.95 
 
 
345 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  49.29 
 
 
350 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.51 
 
 
368 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  46.53 
 
 
349 aa  311  9e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  46.24 
 
 
374 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  44.51 
 
 
368 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  44.51 
 
 
368 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  44.51 
 
 
368 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  45.71 
 
 
383 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  44.03 
 
 
368 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 
368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.02 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1056  A/G-specific adenine glycosylase  47.11 
 
 
349 aa  297  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.992561  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01430  A/G-specific adenine glycosylase  46.42 
 
 
357 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  42.94 
 
 
382 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  44.8 
 
 
381 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.197522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>