More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5983 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
362 aa  752    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  55.26 
 
 
335 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  49.58 
 
 
355 aa  344  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  48.58 
 
 
373 aa  331  1e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  47.21 
 
 
344 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  46.61 
 
 
349 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  46.53 
 
 
350 aa  305  6e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  44.89 
 
 
351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  43.17 
 
 
354 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  42.62 
 
 
407 aa  255  9e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  43.35 
 
 
366 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 
365 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 
365 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  42.8 
 
 
365 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 
365 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 
365 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  42.8 
 
 
365 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  42.8 
 
 
365 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 
365 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  42.05 
 
 
365 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 
365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  42.53 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  39.76 
 
 
383 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  39.78 
 
 
386 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  33.08 
 
 
401 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  43.77 
 
 
366 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 
368 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  41.54 
 
 
368 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  41.54 
 
 
368 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  39.07 
 
 
381 aa  226  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.71 
 
 
368 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 
368 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 
368 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 
368 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 
368 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 
368 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.11 
 
 
363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  35.17 
 
 
347 aa  222  6e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 
368 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 
368 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.94 
 
 
370 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  44.57 
 
 
368 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  41.4 
 
 
369 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.4 
 
 
357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  42.01 
 
 
384 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  43.46 
 
 
353 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  39.18 
 
 
353 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  42.02 
 
 
360 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.08 
 
 
375 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.07 
 
 
342 aa  215  8e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  41.73 
 
 
374 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  42.37 
 
 
356 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.73 
 
 
345 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  41.73 
 
 
386 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  40.3 
 
 
360 aa  209  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  38.85 
 
 
355 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  36.96 
 
 
355 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  40.82 
 
 
383 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 
345 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 
345 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.24 
 
 
368 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  40.23 
 
 
373 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  36.78 
 
 
368 aa  205  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
368 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  44.79 
 
 
368 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  44.79 
 
 
381 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.2 
 
 
363 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
352 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.12 
 
 
345 aa  203  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.79 
 
 
344 aa  203  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  35.62 
 
 
350 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  34.9 
 
 
381 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2284  A/G-specific adenine glycosylase  36.22 
 
 
453 aa  202  8e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.54 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  39.93 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  42.13 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  37.63 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  41.26 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1984  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.21 
 
 
453 aa  199  6e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.328101  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  40.29 
 
 
362 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  39.15 
 
 
354 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  35.53 
 
 
362 aa  199  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  38.52 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  38.52 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  38.52 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  43.43 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  38.52 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  38.13 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  38.52 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  38.52 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  38.13 
 
 
350 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  44.44 
 
 
347 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  39.02 
 
 
344 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  43.43 
 
 
358 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.25 
 
 
368 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.31 
 
 
372 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  33.14 
 
 
355 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34.62 
 
 
352 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  37.08 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>