More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3604 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 
363 aa  734    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  69.69 
 
 
356 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  70.61 
 
 
357 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  70.32 
 
 
357 aa  481  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  63.74 
 
 
370 aa  438  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  60 
 
 
353 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  60 
 
 
357 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  60.63 
 
 
344 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  59.13 
 
 
384 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  60.12 
 
 
368 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  50.43 
 
 
369 aa  322  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  51.87 
 
 
368 aa  322  7e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  52 
 
 
368 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  52 
 
 
368 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  51 
 
 
370 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51 
 
 
368 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  51.71 
 
 
368 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3492  A/G-specific adenine glycosylase  52.13 
 
 
384 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000130303 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  51.86 
 
 
368 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  51.86 
 
 
368 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  51.86 
 
 
368 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  51.86 
 
 
368 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  51.86 
 
 
368 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  51.86 
 
 
368 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  51.86 
 
 
368 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  47.71 
 
 
353 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49 
 
 
375 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  47.96 
 
 
362 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 
362 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  51 
 
 
381 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  51 
 
 
368 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  48.09 
 
 
382 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  42.34 
 
 
368 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  48.91 
 
 
382 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  42.06 
 
 
368 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.65 
 
 
345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  48.29 
 
 
355 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  50.28 
 
 
359 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  43.59 
 
 
381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.39 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.24 
 
 
355 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  46.55 
 
 
355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  41.93 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  47.44 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  42.66 
 
 
383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  50.15 
 
 
355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  47.16 
 
 
355 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  46.55 
 
 
355 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  42.21 
 
 
361 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.98 
 
 
355 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  47.44 
 
 
355 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  42.94 
 
 
372 aa  279  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  42.82 
 
 
419 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  42.94 
 
 
371 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.86 
 
 
344 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  42.58 
 
 
360 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  42.58 
 
 
350 aa  276  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  42.66 
 
 
360 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  41.13 
 
 
350 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  42.58 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  42.58 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  42.58 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  42.58 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  42.37 
 
 
360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  41.46 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  42.29 
 
 
358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  41.97 
 
 
350 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  41.46 
 
 
350 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  41.18 
 
 
350 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  41.5 
 
 
365 aa  272  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  41.18 
 
 
350 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  50.29 
 
 
355 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  42.06 
 
 
358 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  44.26 
 
 
354 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  41.46 
 
 
350 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 
362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  41.95 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  40.51 
 
 
382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  40.5 
 
 
352 aa  268  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  41.71 
 
 
355 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.14 
 
 
372 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.6 
 
 
372 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.58 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.83 
 
 
355 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.89 
 
 
355 aa  266  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.73 
 
 
368 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 
350 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.7 
 
 
355 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  40.39 
 
 
363 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  45.06 
 
 
353 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  40.11 
 
 
363 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  40.11 
 
 
363 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  40.97 
 
 
354 aa  262  8e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  40.11 
 
 
363 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  40.97 
 
 
354 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.44 
 
 
348 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  40.52 
 
 
368 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  43.23 
 
 
370 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.27 
 
 
370 aa  259  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  43.87 
 
 
349 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>