More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3362 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 350 aa  719    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  43.87 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  40.48 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  40.48 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  43.23 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  43.51 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  43.51 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 365 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  43.51 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  43.09 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 365 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  37.82 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  41.07 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  41.07 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  42.11 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.48 
 
 		 374 aa  235  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  37.9 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  38.44 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.16 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  39.76 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  38.59 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  41.9 
 
 		 355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  39.94 
 
 		 355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  37.97 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  39.43 
 
 		 350 aa  225  8e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  39.22 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  39.01 
 
 		 370 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.29 
 
 		 345 aa  222  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  42.21 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.06 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  43.87 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.63 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  38.76 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  37.99 
 
 		 355 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  39.2 
 
 		 365 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  38.31 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  37.38 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  41.1 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.49 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  38.71 
 
 		 355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  38.71 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  38.87 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.54 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.58 
 
 		 355 aa  212  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  33.07 
 
 		 401 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.19 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.33 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  43.07 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  40.55 
 
 		 388 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  39.86 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  39.92 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  37.61 
 
 		 464 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 441 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  37.13 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  38.51 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 		 405 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  38.44 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  38.64 
 
 		 441 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.54 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  40.4 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  35.78 
 
 		 376 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  42.97 
 
 		 355 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  37.87 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.03 
 
 		 363 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  41.3 
 
 		 352 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  39.4 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  42.52 
 
 		 360 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  37.58 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  39.76 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  41.13 
 
 		 396 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  38 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  39.57 
 
 		 374 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.74 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  41.34 
 
 		 434 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  38.41 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  34.38 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  35.87 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  36.8 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  40.43 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.99 
 
 		 368 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  35.59 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 		 615 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.33 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.97 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  38.38 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  37.05 
 
 		 350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  35.62 
 
 		 362 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  40.23 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>