More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3227 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 392 aa  786    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  82.49 
 
 		 415 aa  594  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  73.92 
 
 		 376 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  76.42 
 
 		 367 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  76.16 
 
 		 371 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  75.14 
 
 		 349 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  74.59 
 
 		 357 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  56.61 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  57.71 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  57.37 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  57.14 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  56.73 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  57.14 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  57.69 
 
 		 404 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  58.06 
 
 		 359 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.04 
 
 		 374 aa  356  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  54.14 
 
 		 383 aa  348  9e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  51.79 
 
 		 615 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  50.27 
 
 		 388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  52.08 
 
 		 370 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  52.02 
 
 		 367 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  51.21 
 
 		 358 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  52.03 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  51.21 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.63 
 
 		 344 aa  326  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.14 
 
 		 350 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  51.37 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  49.19 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.92 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  46.58 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.39 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  50.67 
 
 		 354 aa  295  7e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.45 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  48.21 
 
 		 347 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  48.62 
 
 		 369 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.77 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  50.59 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.24 
 
 		 353 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  50.91 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  47.68 
 
 		 333 aa  259  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  47.95 
 
 		 364 aa  259  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.44 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  41.23 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.51 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  41.8 
 
 		 368 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.26 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  41.24 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  41.24 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  41.24 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.19 
 
 		 348 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  43.96 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  43.96 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  39.73 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  43.65 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  43.65 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  43.65 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  43.65 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  43.65 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 369 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.64 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  39.47 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  38.58 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  40.82 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  42.08 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  36.76 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.18 
 
 		 345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  38.15 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  35.42 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  35.34 
 
 		 363 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  38.75 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  36.81 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  37.05 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  35.6 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  37.57 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.34 
 
 		 355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  39.07 
 
 		 382 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.02 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  39.94 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  40.88 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  37.91 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  35.64 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.26 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  38.8 
 
 		 362 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  35.15 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  36.94 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.67 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  35.33 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  34.37 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34.07 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  34.88 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 345 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 345 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  37.58 
 
 		 381 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  38.97 
 
 		 360 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  38.97 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  38.66 
 
 		 362 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.44 
 
 		 363 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  34.59 
 
 		 365 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  34.59 
 
 		 365 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>