More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0028 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 364 aa  721    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  67.54 
 
 		 367 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  67.24 
 
 		 367 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  70.14 
 
 		 353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  67.16 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  65.24 
 
 		 369 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  66.88 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  53.89 
 
 		 388 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  56.93 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  55.94 
 
 		 367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  53.23 
 
 		 615 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.41 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.18 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  50.59 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  52.46 
 
 		 370 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  51.01 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  55.72 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  50.29 
 
 		 358 aa  325  9e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  54.57 
 
 		 464 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  55.22 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  53.43 
 
 		 441 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  53.71 
 
 		 441 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  55.85 
 
 		 355 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  53.51 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  53.56 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.06 
 
 		 350 aa  316  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.22 
 
 		 344 aa  315  9e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.71 
 
 		 359 aa  315  9e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  53.41 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  54.76 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  45.09 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  52.98 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  50.28 
 
 		 371 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.55 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  51.72 
 
 		 376 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  54.44 
 
 		 350 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  50.43 
 
 		 349 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  50.28 
 
 		 357 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  51.01 
 
 		 354 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  48.11 
 
 		 392 aa  279  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  47.48 
 
 		 415 aa  276  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  36.86 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.21 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.04 
 
 		 355 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.59 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.69 
 
 		 353 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  44.09 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  41.53 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  36.57 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.01 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  45.57 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  45.57 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  45.57 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  45.57 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  45.57 
 
 		 368 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  42.22 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  45.22 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  45.57 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  45.22 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  45.22 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  45.57 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.13 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  41.53 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  41.53 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  41.53 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  41.53 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  46.13 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  41.53 
 
 		 360 aa  223  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  39.24 
 
 		 354 aa  222  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  43.32 
 
 		 353 aa  222  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  41.21 
 
 		 360 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  40.33 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  35.87 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  44.69 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  40.89 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  40.89 
 
 		 350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  41.03 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  42.21 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.37 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.95 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  34.15 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  40.58 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  36.77 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  34.85 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  41.18 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  34.15 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.44 
 
 		 357 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  42.43 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  33.6 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  42.63 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  39.47 
 
 		 368 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  41.03 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>