More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2266 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  100 
 
 		 333 aa  656    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  63.66 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  60.55 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.06 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  56.47 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  53.98 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  50.44 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  53.37 
 
 		 367 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  50.44 
 
 		 358 aa  322  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.22 
 
 		 374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  50.14 
 
 		 388 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  57.1 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  51.41 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  51.03 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  51.83 
 
 		 615 aa  312  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  52.92 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  56.49 
 
 		 328 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.61 
 
 		 345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  51.76 
 
 		 383 aa  298  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  53.51 
 
 		 355 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.34 
 
 		 359 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.82 
 
 		 353 aa  289  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  53.85 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  51.45 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  51.45 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  49.42 
 
 		 371 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  52.8 
 
 		 405 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.51 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.13 
 
 		 367 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  50.58 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  55.35 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  50.58 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  48.84 
 
 		 376 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  43.57 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  53.04 
 
 		 405 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 		 349 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  48.99 
 
 		 357 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  47.68 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  45.16 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  48.56 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  51 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  37.27 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  41.69 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  42.74 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.57 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  42.22 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.57 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.57 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.32 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.61 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.54 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  36.16 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.57 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  42.17 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  37.01 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.02 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  34.22 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  34.22 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1851  A/G-specific adenine glycosylase  37.19 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.641505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  38.6 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  38.6 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  38.6 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  39.55 
 
 		 386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  40.35 
 
 		 384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  38.6 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  42.72 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  41.34 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.55 
 
 		 351 aa  212  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  41.34 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  41.34 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.38 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  40.37 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.84 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  39.36 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.63 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.86 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  36.34 
 
 		 350 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  38.23 
 
 		 350 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.87 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  42.38 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  34.29 
 
 		 353 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  38.48 
 
 		 344 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  41.9 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  33.71 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  33.71 
 
 		 388 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.86 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  35.36 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  39.66 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.11 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  37.74 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>