More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0234 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 
365 aa  743    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  46.97 
 
 
352 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.52 
 
 
348 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.75 
 
 
360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  42 
 
 
352 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  45.62 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  41.71 
 
 
352 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  42.78 
 
 
386 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  41.89 
 
 
365 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  39.65 
 
 
383 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.09 
 
 
368 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.09 
 
 
368 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.09 
 
 
368 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.09 
 
 
375 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  43.84 
 
 
350 aa  256  5e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  41.27 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.54 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  41.27 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  43.24 
 
 
362 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 
353 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  41.27 
 
 
355 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  42.16 
 
 
369 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  42.26 
 
 
381 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  43.01 
 
 
370 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  42.69 
 
 
353 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.58 
 
 
372 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.64 
 
 
372 aa  249  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  42.01 
 
 
350 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.67 
 
 
353 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
388 aa  249  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  41.94 
 
 
615 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  40.57 
 
 
354 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  40.36 
 
 
355 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.38 
 
 
372 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  41.12 
 
 
352 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  40.57 
 
 
354 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  42.07 
 
 
354 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  45.6 
 
 
368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  45.6 
 
 
368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  45.6 
 
 
368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  45.6 
 
 
368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  45.6 
 
 
368 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  43.73 
 
 
370 aa  246  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  45.6 
 
 
368 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  45.6 
 
 
368 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  40.53 
 
 
350 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  40.53 
 
 
350 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  41.72 
 
 
350 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  40.53 
 
 
350 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.08 
 
 
368 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  40.53 
 
 
350 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  42.56 
 
 
419 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 
368 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  41.12 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  41.12 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  40.61 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  42.69 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  41.12 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  41.12 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  41.12 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  42.27 
 
 
354 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  41.12 
 
 
368 aa  243  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  40.83 
 
 
360 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  42.38 
 
 
355 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  40.83 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  41.34 
 
 
383 aa  243  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  40.53 
 
 
360 aa  243  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  42.07 
 
 
355 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  39.21 
 
 
367 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.7 
 
 
370 aa  242  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.51 
 
 
345 aa  242  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.51 
 
 
361 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  42.26 
 
 
371 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  43.17 
 
 
357 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  40.53 
 
 
350 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  40.98 
 
 
361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.64 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  41.96 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  43.99 
 
 
362 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  40.62 
 
 
367 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  39.84 
 
 
365 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  41.4 
 
 
382 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  45.51 
 
 
359 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  41.46 
 
 
355 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  41.64 
 
 
355 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  41.62 
 
 
359 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  39.48 
 
 
358 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  40.97 
 
 
370 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  43.75 
 
 
363 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  43.44 
 
 
363 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.62 
 
 
367 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  41.81 
 
 
382 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  43.75 
 
 
363 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1851  A/G-specific adenine glycosylase  41.48 
 
 
381 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.641505  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  43.75 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  44.17 
 
 
374 aa  236  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  40.69 
 
 
358 aa  235  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.46 
 
 
368 aa  235  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  41.32 
 
 
369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>