More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0701 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 615 aa  1247    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  57.46 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  58.82 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  54.95 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  56.68 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.13 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.91 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  52.66 
 
 		 388 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  54.62 
 
 		 357 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  54.06 
 
 		 464 aa  357  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  52.47 
 
 		 358 aa  357  5e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  52.2 
 
 		 358 aa  354  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  54.6 
 
 		 376 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.04 
 
 		 374 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  53.02 
 
 		 349 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  57.3 
 
 		 405 aa  349  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  53.31 
 
 		 383 aa  349  9e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  52.25 
 
 		 392 aa  348  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  52.7 
 
 		 367 aa  346  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.65 
 
 		 359 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.42 
 
 		 350 aa  343  4e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  54.97 
 
 		 441 aa  343  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  54.42 
 
 		 441 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  50.13 
 
 		 415 aa  339  9e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  53.8 
 
 		 404 aa  339  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  54.22 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  52.25 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  52.45 
 
 		 365 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  57.62 
 
 		 405 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.18 
 
 		 359 aa  334  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.94 
 
 		 344 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  47.93 
 
 		 350 aa  327  5e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  50.55 
 
 		 364 aa  326  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  55 
 
 		 328 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.96 
 
 		 353 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  51.11 
 
 		 333 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  48.5 
 
 		 354 aa  299  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  54.08 
 
 		 364 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.99 
 
 		 345 aa  297  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  48.31 
 
 		 347 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  48.6 
 
 		 350 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.01 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  45.77 
 
 		 352 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  43.84 
 
 		 370 aa  253  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  44.85 
 
 		 386 aa  251  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.53 
 
 		 368 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  42.98 
 
 		 368 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  42.98 
 
 		 368 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  42.98 
 
 		 368 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  40.11 
 
 		 350 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.23 
 
 		 355 aa  243  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  42.82 
 
 		 368 aa  243  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.82 
 
 		 368 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.48 
 
 		 345 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  42.82 
 
 		 368 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  42.82 
 
 		 368 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.82 
 
 		 368 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44 
 
 		 353 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  42.82 
 
 		 368 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  42.82 
 
 		 368 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  42.15 
 
 		 369 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  43.24 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.89 
 
 		 355 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.69 
 
 		 375 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  38.62 
 
 		 353 aa  240  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  41.13 
 
 		 362 aa  240  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.11 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  39.5 
 
 		 355 aa  238  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  40.75 
 
 		 382 aa  238  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  38.66 
 
 		 388 aa  237  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.75 
 
 		 354 aa  237  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  40.52 
 
 		 360 aa  236  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  40.52 
 
 		 350 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  40.52 
 
 		 350 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  37.23 
 
 		 360 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  40.23 
 
 		 350 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  40.52 
 
 		 350 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.45 
 
 		 360 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.44 
 
 		 368 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  40.52 
 
 		 350 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  40.23 
 
 		 360 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  39.08 
 
 		 365 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  40.3 
 
 		 365 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  39.83 
 
 		 365 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  40.52 
 
 		 360 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  39.55 
 
 		 365 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  43.54 
 
 		 359 aa  234  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  39.55 
 
 		 365 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  39.55 
 
 		 365 aa  234  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.57 
 
 		 363 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  39.55 
 
 		 365 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  39.94 
 
 		 350 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  39.09 
 
 		 365 aa  233  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  39.09 
 
 		 365 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.45 
 
 		 355 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 		 353 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  39.55 
 
 		 365 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  38.38 
 
 		 386 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  39.26 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  41.01 
 
 		 370 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>