More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7652 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
405 aa  789    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  88.4 
 
 
405 aa  623  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  79.95 
 
 
404 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  79.49 
 
 
441 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  79.24 
 
 
441 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  74.22 
 
 
464 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  62.32 
 
 
367 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  61.74 
 
 
349 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  59.35 
 
 
371 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  61.27 
 
 
355 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  59.71 
 
 
376 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  60.06 
 
 
357 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  60.52 
 
 
374 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  57.1 
 
 
415 aa  362  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  57.91 
 
 
392 aa  362  8e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  57.22 
 
 
615 aa  356  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  56.98 
 
 
358 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  54.96 
 
 
388 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  59.47 
 
 
359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  56.69 
 
 
358 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  56.6 
 
 
367 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.56 
 
 
367 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  57.14 
 
 
365 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  57.69 
 
 
383 aa  342  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  56.53 
 
 
367 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  56.74 
 
 
370 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  53.82 
 
 
364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  56.37 
 
 
328 aa  323  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  54.55 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  53.6 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.88 
 
 
353 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.37 
 
 
359 aa  306  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  52.27 
 
 
347 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.71 
 
 
350 aa  300  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  55.52 
 
 
364 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.46 
 
 
359 aa  292  8e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.57 
 
 
345 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.57 
 
 
344 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  45.82 
 
 
350 aa  290  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  52.33 
 
 
333 aa  276  5e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  53.5 
 
 
350 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  47.37 
 
 
352 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  39.72 
 
 
365 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  40.17 
 
 
364 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 
365 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  39.44 
 
 
365 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 
365 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 
365 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  40.17 
 
 
365 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 
365 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 
365 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  39.44 
 
 
365 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  39.88 
 
 
365 aa  245  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  39.83 
 
 
366 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  39.53 
 
 
352 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.24 
 
 
363 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  39.24 
 
 
352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.54 
 
 
345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  44.38 
 
 
330 aa  233  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.5 
 
 
368 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.94 
 
 
368 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.5 
 
 
368 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.5 
 
 
368 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  39.88 
 
 
386 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  38.84 
 
 
354 aa  229  6e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  38.84 
 
 
354 aa  229  7e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  41.4 
 
 
355 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.16 
 
 
353 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  43.42 
 
 
370 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  41.72 
 
 
355 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  42.44 
 
 
374 aa  227  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  43.56 
 
 
384 aa  226  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  38.9 
 
 
366 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  37.16 
 
 
373 aa  225  1e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  45.69 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.7 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.22 
 
 
375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.69 
 
 
360 aa  223  6e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.24 
 
 
355 aa  223  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2284  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 
453 aa  223  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  42.69 
 
 
386 aa  222  9e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  45.69 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.29 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  42.25 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  45.69 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  45.69 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  45.69 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.59 
 
 
348 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  45.69 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  45.69 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  41.21 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  44.19 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  40.32 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  38.18 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.11 
 
 
365 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 
356 aa  219  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  37.28 
 
 
350 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  39.03 
 
 
382 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.94 
 
 
372 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.94 
 
 
372 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>