More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3504 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  97.51 
 
 		 441 aa  773    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 441 aa  874    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  93.32 
 
 		 404 aa  694    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  77.72 
 
 		 405 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  78.73 
 
 		 405 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  73.45 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.44 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  59.48 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  58.38 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  59.01 
 
 		 376 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  59.65 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.31 
 
 		 374 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  59.3 
 
 		 357 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  55.26 
 
 		 415 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  55.4 
 
 		 388 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  57.99 
 
 		 359 aa  352  8e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  57.14 
 
 		 392 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  56.5 
 
 		 383 aa  345  8e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  53.78 
 
 		 358 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  54.05 
 
 		 615 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  54.9 
 
 		 370 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  55.75 
 
 		 367 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  55.71 
 
 		 365 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  53.49 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  52.2 
 
 		 367 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  53.2 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.2 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.41 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  51.32 
 
 		 369 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.01 
 
 		 353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.71 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  52.31 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  53.48 
 
 		 328 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.91 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.87 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  49.86 
 
 		 347 aa  299  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  44.6 
 
 		 350 aa  290  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.58 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  53.08 
 
 		 364 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  51.45 
 
 		 333 aa  276  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  52.98 
 
 		 350 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  46.33 
 
 		 352 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  38.92 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  38.64 
 
 		 365 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  38.64 
 
 		 365 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  38.64 
 
 		 365 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  38.64 
 
 		 365 aa  243  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  39.19 
 
 		 365 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  38.07 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  40.99 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  38.35 
 
 		 365 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  38.9 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  38.33 
 
 		 365 aa  239  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  38.66 
 
 		 364 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  42.59 
 
 		 355 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.82 
 
 		 386 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  41.33 
 
 		 355 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.71 
 
 		 345 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  47.66 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  41.27 
 
 		 374 aa  226  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  38.12 
 
 		 354 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  38.12 
 
 		 354 aa  223  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.32 
 
 		 363 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  35.07 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  41.21 
 
 		 370 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.12 
 
 		 360 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 386 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.06 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  41.34 
 
 		 368 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  41.34 
 
 		 368 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  41.34 
 
 		 368 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  36.44 
 
 		 366 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  41.87 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  41.38 
 
 		 351 aa  218  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.02 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  36.89 
 
 		 354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  38.64 
 
 		 350 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.91 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  36.6 
 
 		 350 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39.73 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  40.61 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.33 
 
 		 365 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  39.73 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  41.14 
 
 		 355 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  38.44 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 		 356 aa  210  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  41.14 
 
 		 355 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  41.54 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  38.26 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.85 
 
 		 375 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>