More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4978 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 349 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  86.05 
 
 		 376 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  86.34 
 
 		 357 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  78.96 
 
 		 367 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  77.81 
 
 		 371 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  75.14 
 
 		 392 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  70.37 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  62.57 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  61.95 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  62.79 
 
 		 405 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  62.72 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  59.38 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  59.94 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  62.43 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  59.71 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.06 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  57.18 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  53.98 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  54.89 
 
 		 358 aa  355  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  54.6 
 
 		 358 aa  355  6.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  55.43 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.35 
 
 		 350 aa  345  5e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  53.02 
 
 		 615 aa  345  8.999999999999999e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  54.39 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  53.6 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  52.44 
 
 		 367 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  49.14 
 
 		 350 aa  324  2e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.03 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  52.34 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.05 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.85 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.29 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  53.16 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  52.66 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  49.01 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.71 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  49.12 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  51.16 
 
 		 350 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.1 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  50.29 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  50.73 
 
 		 364 aa  273  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.76 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  43.11 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.18 
 
 		 375 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  41.36 
 
 		 369 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.29 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  43.43 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.36 
 
 		 348 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  41.71 
 
 		 368 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.25 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  41.71 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  41.71 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  45.28 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  45.28 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  45.28 
 
 		 368 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  45.28 
 
 		 368 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  45.28 
 
 		 368 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  45.28 
 
 		 368 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  45.28 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  43.23 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  42.44 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  41.82 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  42.44 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  41.86 
 
 		 381 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  42.44 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  42.12 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  42.44 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  42.44 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  42.44 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  41.78 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  40.62 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  42.44 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.03 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.81 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  44.08 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  37.1 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.88 
 
 		 355 aa  229  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.09 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  37.12 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.18 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  42.39 
 
 		 355 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  39.47 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  40.72 
 
 		 355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  40.32 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  41.5 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  41.53 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.6 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.39 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  38.69 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  41.56 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  41.56 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  41.53 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  42.53 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  41.25 
 
 		 350 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  41.58 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  37.98 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>