More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1092 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 388 aa  796    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  75.42 
 
 		 365 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  74.86 
 
 		 367 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  70.31 
 
 		 370 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  63.79 
 
 		 374 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  63.43 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  63.14 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  65.16 
 
 		 364 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  59.89 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  50.71 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  53.82 
 
 		 367 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  56.03 
 
 		 359 aa  358  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.52 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.05 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.65 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  54.89 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  53.8 
 
 		 464 aa  348  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.24 
 
 		 359 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.2 
 
 		 350 aa  346  4e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  55.14 
 
 		 357 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  56.25 
 
 		 404 aa  345  8e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  52.96 
 
 		 615 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  55.68 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  53.87 
 
 		 371 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  55.4 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  53.5 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  55.62 
 
 		 405 aa  339  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  53.67 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  53.06 
 
 		 369 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.82 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.13 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  54.39 
 
 		 405 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  50.27 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  51.69 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.88 
 
 		 345 aa  316  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  54.21 
 
 		 328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  46.86 
 
 		 415 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  52.63 
 
 		 350 aa  303  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  50.43 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  53.96 
 
 		 364 aa  291  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  47.46 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  45.51 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.97 
 
 		 360 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  40.83 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  40.83 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  40.83 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.17 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  39.18 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.3 
 
 		 353 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.81 
 
 		 361 aa  229  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.36 
 
 		 368 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  42.36 
 
 		 368 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.36 
 
 		 368 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  42.36 
 
 		 368 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  38.89 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  38.86 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  42.36 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  40.51 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  42.36 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  39.38 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  38.92 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  41.82 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  41.42 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  41.83 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  40.26 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  39 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  41.91 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.99 
 
 		 375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.67 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  41.42 
 
 		 350 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  41.42 
 
 		 350 aa  226  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  41.62 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  41.42 
 
 		 350 aa  226  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  41.42 
 
 		 350 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  42.04 
 
 		 368 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  41.42 
 
 		 360 aa  226  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  41.35 
 
 		 350 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  41.5 
 
 		 360 aa  226  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  41.35 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  41.35 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  41.35 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  39.56 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.54 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  42.39 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  43.45 
 
 		 368 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  42.81 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  40.78 
 
 		 350 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.17 
 
 		 368 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 		 351 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.69 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  37.25 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  39.4 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  36.75 
 
 		 366 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  39.49 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  40.06 
 
 		 361 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  40 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  38.76 
 
 		 354 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  39.22 
 
 		 350 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>