More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2645 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 		 353 aa  719    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  64.99 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.77 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  61.24 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  59.21 
 
 		 367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  70.96 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  63.43 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  54.13 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  56.16 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  54.91 
 
 		 365 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.33 
 
 		 374 aa  332  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  53.8 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.3 
 
 		 359 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  49.57 
 
 		 383 aa  319  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  50.58 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  51.4 
 
 		 370 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  50.96 
 
 		 615 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.29 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  52.19 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  51.15 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.42 
 
 		 359 aa  309  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  51.01 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  50.72 
 
 		 441 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  48.68 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  48.68 
 
 		 358 aa  305  7e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  52.17 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  50.14 
 
 		 404 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.83 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  50.44 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 		 359 aa  292  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  49.86 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.32 
 
 		 367 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  57.05 
 
 		 350 aa  288  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  54.82 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  49.56 
 
 		 371 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  49.85 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  41.98 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  47.81 
 
 		 349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  47.81 
 
 		 357 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  46.51 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  43.82 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.13 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.37 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.51 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.56 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  42.24 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.43 
 
 		 354 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.97 
 
 		 355 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  39.21 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  38.23 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  38.23 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.14 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.99 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  42.95 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.97 
 
 		 363 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  39.17 
 
 		 368 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  41.45 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  39.25 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  41.4 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  37.82 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.62 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  41.21 
 
 		 355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  41.72 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 		 386 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  41.4 
 
 		 355 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  38.66 
 
 		 382 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  37.65 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 365 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 		 353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 368 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  40.13 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.74 
 
 		 372 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.74 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  36.53 
 
 		 354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  36.53 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  36.1 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  35.76 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  36.1 
 
 		 365 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  36.1 
 
 		 365 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  36.1 
 
 		 365 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  36.1 
 
 		 365 aa  212  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.16 
 
 		 375 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  43.35 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.68 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  35.76 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.51 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  39.81 
 
 		 355 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  36.19 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  41.14 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>