More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1219 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 		 370 aa  776    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  77.07 
 
 		 382 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  72.03 
 
 		 365 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  72.03 
 
 		 363 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  70.45 
 
 		 354 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  69.25 
 
 		 372 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  68.98 
 
 		 372 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  69.25 
 
 		 372 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  71.95 
 
 		 362 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  71.75 
 
 		 363 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  71.75 
 
 		 363 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  71.75 
 
 		 363 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  68.78 
 
 		 368 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  69.05 
 
 		 368 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  67.05 
 
 		 357 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  66.38 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  60.47 
 
 		 371 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  60.47 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  59.88 
 
 		 372 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  58.24 
 
 		 381 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  57.58 
 
 		 360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  59.01 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  57.71 
 
 		 360 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  57.3 
 
 		 360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  57.47 
 
 		 368 aa  441  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  58.14 
 
 		 350 aa  441  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  57.18 
 
 		 368 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  58.14 
 
 		 350 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  58.14 
 
 		 350 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  58.14 
 
 		 350 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  59.17 
 
 		 363 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  58.14 
 
 		 350 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  57.27 
 
 		 350 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  57.27 
 
 		 350 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  58.14 
 
 		 350 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  56.98 
 
 		 350 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  56.98 
 
 		 350 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  57.27 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0376  A/G-specific adenine glycosylase  61.03 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.798144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  57.1 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  58.77 
 
 		 354 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  57.89 
 
 		 350 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  56.07 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  54.44 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.47 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.94 
 
 		 370 aa  391  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  54.26 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  56.13 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  51 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  51.28 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  51.16 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  54.39 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  51 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.45 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.9 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  50.71 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  52.35 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  50.58 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  51.33 
 
 		 362 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  51.3 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.14 
 
 		 355 aa  352  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  48.41 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  49.56 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.73 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  51.76 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  45.71 
 
 		 369 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.86 
 
 		 375 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.63 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  46.2 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  47.98 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  47.98 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  47.86 
 
 		 353 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.91 
 
 		 368 aa  335  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  46.91 
 
 		 368 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  46.91 
 
 		 368 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  46.91 
 
 		 368 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  51.3 
 
 		 354 aa  333  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  51.49 
 
 		 368 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.48 
 
 		 345 aa  332  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  51.49 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  51.49 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  46.76 
 
 		 370 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  49.12 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  51.16 
 
 		 368 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  51.16 
 
 		 368 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  51.16 
 
 		 368 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  51.16 
 
 		 368 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  49.15 
 
 		 350 aa  329  6e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  47.62 
 
 		 383 aa  326  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  46.61 
 
 		 355 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.98 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  46.61 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.15 
 
 		 368 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  47.75 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  45.22 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  47.47 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  43.53 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  42.15 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  43.34 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1141  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 358 aa  291  9e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>