More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0493 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
358 aa  733    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  99.44 
 
 
358 aa  726    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  80.39 
 
 
364 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  63.43 
 
 
388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  63.36 
 
 
370 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  66.29 
 
 
367 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  64.25 
 
 
374 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  63.82 
 
 
365 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  55.36 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  56.01 
 
 
359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  57.14 
 
 
355 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  52.89 
 
 
367 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.6 
 
 
367 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  55.72 
 
 
383 aa  346  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  55.2 
 
 
376 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  55.27 
 
 
371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.47 
 
 
350 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.89 
 
 
367 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  52.5 
 
 
464 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  54.89 
 
 
349 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  57.1 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  55.2 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  52.2 
 
 
615 aa  336  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  52.59 
 
 
369 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.26 
 
 
344 aa  332  8e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  56.1 
 
 
405 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  53.49 
 
 
441 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  53.49 
 
 
441 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  49.74 
 
 
415 aa  322  5e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  51.21 
 
 
392 aa  318  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  52.62 
 
 
404 aa  318  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.57 
 
 
359 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.18 
 
 
345 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  50.86 
 
 
354 aa  309  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  50.44 
 
 
333 aa  305  9.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.44 
 
 
359 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  52.04 
 
 
328 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  50.43 
 
 
347 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.68 
 
 
353 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  50.9 
 
 
364 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  48.82 
 
 
350 aa  279  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  42.94 
 
 
353 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  41.45 
 
 
352 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.9 
 
 
363 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  39.77 
 
 
383 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.46 
 
 
360 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  41.07 
 
 
350 aa  236  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  43.71 
 
 
330 aa  236  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  40.48 
 
 
355 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  41.61 
 
 
355 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  41.61 
 
 
355 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  39.76 
 
 
355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  42.63 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.27 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  38.75 
 
 
360 aa  233  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  41.06 
 
 
362 aa  232  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  37.98 
 
 
350 aa  232  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.32 
 
 
353 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  43.23 
 
 
362 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.04 
 
 
355 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  40.52 
 
 
384 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  38.51 
 
 
386 aa  228  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  39.67 
 
 
382 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  40.89 
 
 
355 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 
344 aa  227  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40 
 
 
355 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 
344 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.44 
 
 
357 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  38.72 
 
 
356 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  36.21 
 
 
386 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  37.43 
 
 
388 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  39.13 
 
 
382 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  38.33 
 
 
357 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  41.04 
 
 
351 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.24 
 
 
357 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  36.69 
 
 
355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.97 
 
 
368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  36.72 
 
 
355 aa  222  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
370 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  43.07 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  40.98 
 
 
350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  41.94 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  40.59 
 
 
381 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  39.74 
 
 
368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  41.23 
 
 
350 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  38.66 
 
 
370 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  41.23 
 
 
350 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
366 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
368 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.37 
 
 
361 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
368 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
368 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
368 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
368 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
368 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  37.54 
 
 
369 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  36.84 
 
 
353 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  40.78 
 
 
350 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  39.87 
 
 
350 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  41.53 
 
 
368 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>