More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5884 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
355 aa  719    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  96.06 
 
 
355 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  84.53 
 
 
362 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  80.85 
 
 
355 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  80.56 
 
 
355 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  79.66 
 
 
355 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  80.23 
 
 
355 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  79.55 
 
 
355 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  79.1 
 
 
355 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  78.81 
 
 
355 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  79.1 
 
 
355 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.64 
 
 
353 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  53.11 
 
 
355 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  53.78 
 
 
360 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  50.87 
 
 
365 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  53.49 
 
 
419 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  52.84 
 
 
370 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  53.78 
 
 
350 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  50.44 
 
 
368 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  51.86 
 
 
354 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51 
 
 
372 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  53.49 
 
 
360 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  53.78 
 
 
360 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  53.78 
 
 
350 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  53.78 
 
 
350 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  53.2 
 
 
350 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  53.78 
 
 
350 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  53.49 
 
 
371 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  53.78 
 
 
350 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.17 
 
 
348 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  52.62 
 
 
372 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.57 
 
 
372 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.14 
 
 
372 aa  362  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  51.74 
 
 
381 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  49.85 
 
 
382 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  52.62 
 
 
350 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  52.62 
 
 
350 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  52.62 
 
 
350 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  52.62 
 
 
350 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  51.16 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  47.81 
 
 
354 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  52.33 
 
 
350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  52.01 
 
 
368 aa  355  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  51.72 
 
 
368 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.74 
 
 
355 aa  352  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  51.31 
 
 
350 aa  351  8.999999999999999e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  51.48 
 
 
361 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  50.15 
 
 
362 aa  348  9e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  50.43 
 
 
350 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.27 
 
 
375 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  52.66 
 
 
363 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  51.01 
 
 
353 aa  346  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 
363 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 
363 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  53.71 
 
 
354 aa  345  8.999999999999999e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 
363 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  51.9 
 
 
353 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  51 
 
 
369 aa  342  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  49.71 
 
 
363 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  48.41 
 
 
357 aa  341  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  49.15 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  50.58 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  53.6 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  49.15 
 
 
354 aa  337  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  51.7 
 
 
353 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  53.6 
 
 
370 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.91 
 
 
370 aa  335  9e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  50 
 
 
362 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  52.46 
 
 
368 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.03 
 
 
368 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  51 
 
 
358 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.35 
 
 
361 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  52.17 
 
 
368 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  51.26 
 
 
382 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  52.17 
 
 
368 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  50.29 
 
 
350 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  50.57 
 
 
362 aa  329  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  50.14 
 
 
358 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  50.83 
 
 
382 aa  328  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.44 
 
 
345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  48.57 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  51.99 
 
 
368 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  47.06 
 
 
355 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  51.99 
 
 
368 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  52.46 
 
 
368 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  52.46 
 
 
368 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  52.46 
 
 
368 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  52.46 
 
 
368 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  46.76 
 
 
355 aa  322  9.000000000000001e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  51.7 
 
 
368 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.66 
 
 
368 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0376  A/G-specific adenine glycosylase  45.63 
 
 
358 aa  315  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.798144  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  48.31 
 
 
351 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  47.99 
 
 
374 aa  310  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.45 
 
 
344 aa  308  8e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  47.48 
 
 
383 aa  306  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.02 
 
 
363 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  47.2 
 
 
359 aa  299  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  46.9 
 
 
349 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>