More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0748 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
383 aa  776    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  61.54 
 
 
359 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.59 
 
 
374 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  59.24 
 
 
355 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.24 
 
 
367 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  56.6 
 
 
349 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  55.72 
 
 
358 aa  360  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  55.72 
 
 
358 aa  358  6e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  58.11 
 
 
376 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  58.58 
 
 
404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  53.5 
 
 
388 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  57.02 
 
 
371 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  53.5 
 
 
367 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  56.5 
 
 
441 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  56.5 
 
 
441 aa  346  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  54.78 
 
 
365 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  54.14 
 
 
392 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  52.97 
 
 
415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  54.39 
 
 
615 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  54.94 
 
 
364 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  56.05 
 
 
357 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  57.91 
 
 
405 aa  342  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.53 
 
 
344 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  54.46 
 
 
464 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  57.99 
 
 
405 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  49.28 
 
 
350 aa  329  6e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.73 
 
 
350 aa  328  7e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  51.37 
 
 
367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  53.46 
 
 
370 aa  325  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.68 
 
 
367 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  54.26 
 
 
354 aa  322  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.43 
 
 
359 aa  322  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.14 
 
 
345 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.57 
 
 
353 aa  315  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.63 
 
 
359 aa  311  7.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  50.73 
 
 
369 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  52.27 
 
 
328 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  51.76 
 
 
333 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  50.28 
 
 
350 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  53.89 
 
 
364 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  46.39 
 
 
347 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.48 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  44.87 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
382 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  40.24 
 
 
365 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.13 
 
 
370 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  39.4 
 
 
365 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  42.98 
 
 
353 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 
368 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  39.05 
 
 
365 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  39.05 
 
 
365 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  39.05 
 
 
365 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  39.05 
 
 
365 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.64 
 
 
355 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.38 
 
 
368 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.09 
 
 
355 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  39.35 
 
 
365 aa  239  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  39.05 
 
 
365 aa  238  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  41.25 
 
 
354 aa  239  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  46.36 
 
 
362 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  37.96 
 
 
352 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.37 
 
 
368 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.9 
 
 
375 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.14 
 
 
383 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  38.81 
 
 
365 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  38.76 
 
 
365 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  40.12 
 
 
355 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  42.11 
 
 
368 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  42.11 
 
 
368 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  42.51 
 
 
355 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  41.74 
 
 
369 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  37.68 
 
 
352 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 
386 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.15 
 
 
361 aa  236  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2284  A/G-specific adenine glycosylase  44.62 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  42.39 
 
 
355 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1984  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.23 
 
 
453 aa  233  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.328101  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  42.51 
 
 
355 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  40.78 
 
 
383 aa  233  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.67 
 
 
353 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.54 
 
 
355 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  39.41 
 
 
350 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  44.81 
 
 
368 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  44.81 
 
 
368 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  44.81 
 
 
368 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  44.81 
 
 
368 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  44.81 
 
 
368 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  44.81 
 
 
368 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  43.96 
 
 
355 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  40.06 
 
 
374 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 
364 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  40.74 
 
 
362 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  44.48 
 
 
368 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  43.04 
 
 
355 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  39.8 
 
 
353 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  40.11 
 
 
360 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  41.49 
 
 
355 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.18 
 
 
345 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  42.63 
 
 
355 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>