More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2130 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 		 344 aa  695    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.03 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  56.45 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  56.16 
 
 		 368 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  56.16 
 
 		 368 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.86 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  56 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  54.78 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  56.48 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  55.87 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  58.65 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  57.06 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.59 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  54.05 
 
 		 368 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  54.05 
 
 		 368 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  54.05 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  53.76 
 
 		 368 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  53.76 
 
 		 368 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  53.76 
 
 		 368 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  53.76 
 
 		 368 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  52.68 
 
 		 362 aa  358  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  51.99 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  55.17 
 
 		 368 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  55.65 
 
 		 381 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.61 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  51.13 
 
 		 382 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  48.42 
 
 		 365 aa  348  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.77 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  49.57 
 
 		 350 aa  345  8.999999999999999e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.94 
 
 		 372 aa  342  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.61 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.97 
 
 		 372 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  49.86 
 
 		 354 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  45.93 
 
 		 354 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0295  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.35 
 
 		 405 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  50.58 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  48.85 
 
 		 362 aa  332  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  47.43 
 
 		 363 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  47.43 
 
 		 363 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  47.43 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  51.66 
 
 		 368 aa  329  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  47.43 
 
 		 363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0348  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.09 
 
 		 393 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  46.09 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.73 
 
 		 353 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  46.8 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  50.83 
 
 		 370 aa  325  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  46.11 
 
 		 357 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  49.86 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  51.03 
 
 		 355 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  46.47 
 
 		 354 aa  320  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  51.74 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  46.09 
 
 		 352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  47.04 
 
 		 361 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 350 aa  317  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  46.02 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  50.14 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  46.02 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  45.74 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 350 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 350 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 350 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  48.82 
 
 		 355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  47.37 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  48.82 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  48.82 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  46.24 
 
 		 355 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  46.78 
 
 		 372 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  48.53 
 
 		 355 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  44.54 
 
 		 368 aa  312  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  48.82 
 
 		 355 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.82 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  47.38 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  47.08 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.27 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  51.31 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  45.43 
 
 		 353 aa  309  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  45.35 
 
 		 381 aa  308  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  46.33 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.26 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0376  A/G-specific adenine glycosylase  45.53 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.798144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  46.13 
 
 		 357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  44.13 
 
 		 368 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.52 
 
 		 361 aa  305  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  46.97 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  44.31 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.72 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  43.73 
 
 		 355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  48.09 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  44.67 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  44.67 
 
 		 354 aa  299  5e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  49.29 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  45.86 
 
 		 363 aa  299  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>