More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4995 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 291 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  74.74 
 
 		 296 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  74.23 
 
 		 291 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  75.35 
 
 		 291 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  73.05 
 
 		 287 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  70.82 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  62.72 
 
 		 288 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  61.57 
 
 		 310 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  61.03 
 
 		 303 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  58.42 
 
 		 299 aa  330  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  57.68 
 
 		 293 aa  325  7e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  59.45 
 
 		 299 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  58.82 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  60.15 
 
 		 315 aa  308  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  55.9 
 
 		 300 aa  308  8e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  58.45 
 
 		 288 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  58.45 
 
 		 288 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  58.45 
 
 		 288 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  58.66 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  59.07 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  55.2 
 
 		 329 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  55.24 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  56.21 
 
 		 313 aa  298  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  55.04 
 
 		 300 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  55.79 
 
 		 304 aa  292  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  55.48 
 
 		 290 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  57.19 
 
 		 291 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  54.97 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  56.06 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  56.58 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  52.71 
 
 		 285 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  54.9 
 
 		 313 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  54.7 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  54.96 
 
 		 581 aa  268  7e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  51.96 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  55.48 
 
 		 285 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  42.46 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.33 
 
 		 331 aa  228  6e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  41.72 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  44.44 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  39.25 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  44.35 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  42.91 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  41.74 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  46.4 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.36 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  43.05 
 
 		 382 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  37.04 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.5 
 
 		 375 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  45.28 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  40.15 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  39.74 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  42.61 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  40.45 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  42.92 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.06 
 
 		 361 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 368 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  43.72 
 
 		 368 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  42.33 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  41.09 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  39.64 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.99 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  40.55 
 
 		 362 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  39.07 
 
 		 382 aa  158  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  39.63 
 
 		 363 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  38.14 
 
 		 360 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  39.63 
 
 		 363 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  39.3 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  39.63 
 
 		 363 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  38.14 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  38.14 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  38.14 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  42.79 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  39.63 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  39.45 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  38.14 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  38.14 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  39.58 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  38.14 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.94 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  37.71 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  42.23 
 
 		 355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  42.79 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  41.35 
 
 		 360 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  37.71 
 
 		 350 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.44 
 
 		 372 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.17 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  41.47 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  38.21 
 
 		 344 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  39.81 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>