More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2939 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  100 
 
 
306 aa  623  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  72.67 
 
 
309 aa  458  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  70.49 
 
 
305 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  72.2 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  75.42 
 
 
319 aa  435  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  42.3 
 
 
318 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  40.88 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  41.35 
 
 
308 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  38.29 
 
 
323 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  40.85 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  39.58 
 
 
287 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  39.73 
 
 
355 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  45.07 
 
 
383 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  39.3 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  40.27 
 
 
303 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  34.26 
 
 
278 aa  166  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  39.38 
 
 
366 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  32.98 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  34.01 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  37.74 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  36.8 
 
 
328 aa  163  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  39.12 
 
 
288 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  38.2 
 
 
396 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  41.56 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.93 
 
 
368 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 
435 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  39.07 
 
 
347 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  42.21 
 
 
291 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  37.66 
 
 
373 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  41.2 
 
 
382 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.48 
 
 
360 aa  159  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  38.23 
 
 
304 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  37.39 
 
 
345 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  37.39 
 
 
345 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  34.63 
 
 
278 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  33.22 
 
 
278 aa  158  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  39.66 
 
 
303 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  38.4 
 
 
360 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  37.34 
 
 
222 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  35.79 
 
 
298 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  39.72 
 
 
373 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  36.36 
 
 
311 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  38.33 
 
 
291 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  40.87 
 
 
272 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  37.63 
 
 
310 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  35.58 
 
 
285 aa  156  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  40.16 
 
 
296 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.39 
 
 
352 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.39 
 
 
352 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  38.19 
 
 
300 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  37.67 
 
 
347 aa  155  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  42.29 
 
 
315 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
365 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
365 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
365 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
365 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
365 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
365 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
365 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
365 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  40.67 
 
 
324 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  37.05 
 
 
365 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  42.31 
 
 
351 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  38.73 
 
 
371 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  39.15 
 
 
386 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  38.28 
 
 
360 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  42.16 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  38.98 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  35.82 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 
383 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  37.22 
 
 
364 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  39.51 
 
 
253 aa  152  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  37.33 
 
 
374 aa  152  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  38.38 
 
 
299 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  37.56 
 
 
352 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  39.04 
 
 
330 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  37.35 
 
 
331 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  37.74 
 
 
365 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  36.05 
 
 
293 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  36.51 
 
 
308 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  39.23 
 
 
349 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.71 
 
 
368 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  41.33 
 
 
335 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  37.11 
 
 
299 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  40.49 
 
 
350 aa  149  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  34.04 
 
 
294 aa  149  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  39.6 
 
 
581 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  37.32 
 
 
381 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  34.49 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  38.49 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  35.68 
 
 
434 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  36.48 
 
 
335 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 
354 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  39.52 
 
 
362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  36.55 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  36.55 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  36.55 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  37.85 
 
 
350 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  38.74 
 
 
353 aa  145  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>