More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0971 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  100 
 
 
285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  61.89 
 
 
278 aa  355  5e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  61.17 
 
 
278 aa  347  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  59.78 
 
 
298 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  58.76 
 
 
281 aa  323  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  55.39 
 
 
278 aa  298  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  59.07 
 
 
222 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  43.24 
 
 
294 aa  192  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  41.95 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  43.04 
 
 
285 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  39.23 
 
 
298 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  37.93 
 
 
299 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  33.97 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  40.49 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  39.1 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  41.05 
 
 
297 aa  161  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  41.55 
 
 
313 aa  159  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  35.84 
 
 
285 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  38.89 
 
 
288 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 
330 aa  152  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  32.99 
 
 
305 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  37.25 
 
 
308 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  38.35 
 
 
396 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  38.34 
 
 
317 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  34.01 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  34.52 
 
 
331 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  41.11 
 
 
360 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  33.58 
 
 
287 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  33.58 
 
 
311 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  37.37 
 
 
435 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  34.43 
 
 
319 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  32.68 
 
 
323 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  35.15 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  36.15 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  37.55 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  36.26 
 
 
581 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35 
 
 
355 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  38.97 
 
 
373 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  38 
 
 
434 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  33.12 
 
 
328 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  32.62 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.5 
 
 
368 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  33.1 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  37.24 
 
 
333 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  37.56 
 
 
370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  40.53 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  40.1 
 
 
303 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  32.13 
 
 
290 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  32.98 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  36.86 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  33.7 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  33.7 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  33.7 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  37.06 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  37.06 
 
 
368 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  37.06 
 
 
368 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  38.92 
 
 
381 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.55 
 
 
368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  33.49 
 
 
354 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  33.94 
 
 
315 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  36.09 
 
 
315 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  35.26 
 
 
388 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  39.47 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  37.24 
 
 
419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  41.86 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  32.75 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.96 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  37.76 
 
 
372 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  30.99 
 
 
291 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.11 
 
 
386 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  36.7 
 
 
368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.15 
 
 
375 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.6 
 
 
345 aa  126  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
355 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  36.89 
 
 
352 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.58 
 
 
361 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  39.78 
 
 
350 aa  125  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  38.78 
 
 
382 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  35.15 
 
 
388 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  36.07 
 
 
354 aa  125  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  32.66 
 
 
307 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  30.22 
 
 
291 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 
368 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  32.91 
 
 
363 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 
368 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 
368 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 
368 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 
368 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  34.8 
 
 
285 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  36.07 
 
 
354 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 
368 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  36.17 
 
 
368 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  38.34 
 
 
355 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  35.71 
 
 
381 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  34.36 
 
 
368 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  36.73 
 
 
371 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  32.14 
 
 
386 aa  123  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  41.24 
 
 
464 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>