More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1654 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  100 
 
 		 285 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  63.31 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  55.4 
 
 		 299 aa  325  7e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  51.88 
 
 		 294 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  50.19 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  50.57 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  50.74 
 
 		 291 aa  259  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  51.85 
 
 		 315 aa  247  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  46.93 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  45.52 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  45 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  44.65 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  43.66 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  42.61 
 
 		 278 aa  191  8e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  43.61 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  39.39 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  44.1 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  41.95 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  44.29 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  39 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  41.32 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  39.15 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  39.68 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  44.9 
 
 		 356 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  38.49 
 
 		 368 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.49 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.71 
 
 		 345 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  38.49 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.49 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.49 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.49 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  38.49 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  44.12 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  44.12 
 
 		 368 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  44.12 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  37.85 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.98 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  43.14 
 
 		 370 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  41.75 
 
 		 324 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  37.14 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.16 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  44.39 
 
 		 362 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.82 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  44.5 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 357 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  43.39 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.56 
 
 		 363 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  44.89 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.16 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  37.63 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  44.39 
 
 		 382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.87 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 360 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  43.65 
 
 		 369 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.96 
 
 		 357 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  39.61 
 
 		 383 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  46.89 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  36.05 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  43.97 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  36.65 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  48.57 
 
 		 353 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  38.86 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  40.76 
 
 		 358 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  44.44 
 
 		 381 aa  136  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  39.04 
 
 		 370 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  36.82 
 
 		 355 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 		 370 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0131  A/G-specific adenine glycosylase  42.02 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  37.88 
 
 		 407 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.97 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  35.18 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  40.76 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  41.58 
 
 		 352 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  35.18 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  38.34 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  38.34 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  38.34 
 
 		 365 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  37.82 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  37.82 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  37.82 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.46 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  37.82 
 
 		 365 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  37.82 
 
 		 365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  37.82 
 
 		 365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.01 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  43.39 
 
 		 382 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  40.41 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  33.08 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  40.31 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  38.34 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  30.79 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.43 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  37.96 
 
 		 351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.7 
 
 		 350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  40.76 
 
 		 388 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  36.13 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>