More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1020 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  58.78 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  58.11 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  55.56 
 
 		 278 aa  321  9.000000000000001e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  60.8 
 
 		 281 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  68.57 
 
 		 222 aa  311  9e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  56.75 
 
 		 285 aa  295  6e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  41.54 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  42.75 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  39 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  39.05 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  38.1 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  37.26 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  36.95 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  37.16 
 
 		 292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  36.64 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  38.58 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  34.84 
 
 		 317 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  35.36 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  35.05 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  34.63 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  38.52 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  34.12 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  39.25 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  39.25 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  33.91 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.06 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  35.94 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  36.79 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 396 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  37.84 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  33.82 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  36.62 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  38.3 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  34.52 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  32.93 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.81 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  36.02 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  35.16 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.46 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  38.16 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  36.76 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  36.03 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  40.32 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  36.84 
 
 		 435 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  33.22 
 
 		 335 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  36.27 
 
 		 388 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 407 aa  132  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  34.57 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  36.65 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  33.21 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  36.45 
 
 		 354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  33.45 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  34.91 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  34.34 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  36.9 
 
 		 419 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.88 
 
 		 348 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  38.38 
 
 		 434 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  33.94 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  32.72 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  34.45 
 
 		 371 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.04 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  34.3 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  32.06 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  32.73 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 		 381 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.07 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  37.57 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.53 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  32.39 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  33.97 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  35.89 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  40.61 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  35.87 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  33.21 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  33.05 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  33.56 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  34.17 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  32.39 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.59 
 
 		 359 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  34.22 
 
 		 368 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  36.32 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  36.23 
 
 		 381 aa  125  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  30.35 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  35.08 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  34.22 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  34.03 
 
 		 344 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  37.97 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  33.98 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>