More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3282 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  100 
 
 
303 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  63.46 
 
 
315 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  68.1 
 
 
581 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  60.4 
 
 
313 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  58.9 
 
 
313 aa  296  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  59.45 
 
 
307 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  57.34 
 
 
288 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  58.19 
 
 
291 aa  288  7e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  58.55 
 
 
311 aa  288  7e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  57.14 
 
 
296 aa  278  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  54.7 
 
 
291 aa  275  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  59.38 
 
 
311 aa  275  7e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  59.93 
 
 
285 aa  271  7e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  55.79 
 
 
291 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  57.19 
 
 
293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  56.08 
 
 
308 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  53.66 
 
 
329 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  54.23 
 
 
287 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  60.44 
 
 
335 aa  263  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  54.71 
 
 
299 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  53.29 
 
 
310 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  55.07 
 
 
299 aa  255  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  52.19 
 
 
347 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  54.12 
 
 
288 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  54.12 
 
 
288 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  54.12 
 
 
288 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  53.56 
 
 
303 aa  247  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  54.87 
 
 
290 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  54.85 
 
 
303 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  58.12 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  50.33 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  51.32 
 
 
320 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  54.68 
 
 
304 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  54.81 
 
 
285 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  54.84 
 
 
291 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  43.36 
 
 
331 aa  227  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  48.81 
 
 
300 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  43.67 
 
 
328 aa  219  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  47.52 
 
 
272 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  39.8 
 
 
318 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  43.51 
 
 
383 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  40.91 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  39.93 
 
 
309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  44.02 
 
 
388 aa  165  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  46.3 
 
 
382 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0129  helix-hairpin-helix motif protein  37.34 
 
 
349 aa  162  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  39.53 
 
 
305 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.21 
 
 
344 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  49.29 
 
 
355 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  41.5 
 
 
351 aa  158  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  42.92 
 
 
330 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  39.77 
 
 
323 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.47 
 
 
359 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  42.06 
 
 
350 aa  156  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  40.27 
 
 
306 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.41 
 
 
353 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  37.7 
 
 
330 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  44.71 
 
 
367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  46.89 
 
 
383 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  45.97 
 
 
359 aa  152  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  40.58 
 
 
344 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  39.53 
 
 
319 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  41.12 
 
 
373 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  45.62 
 
 
615 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.43 
 
 
359 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  37.73 
 
 
364 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  44.02 
 
 
365 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  36.74 
 
 
365 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  36.74 
 
 
365 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.41 
 
 
367 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.45 
 
 
361 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43811  predicted protein  39.11 
 
 
245 aa  149  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 
365 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 
365 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 
365 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 
365 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  44.34 
 
 
382 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 
358 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  36.74 
 
 
365 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 
365 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  42.97 
 
 
371 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.47 
 
 
354 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  37.98 
 
 
298 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.95 
 
 
357 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 
365 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 
365 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  41.95 
 
 
357 aa  148  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.79 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  42.06 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  42.53 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  37.98 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  40.18 
 
 
366 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  38.68 
 
 
358 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.53 
 
 
357 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  42.39 
 
 
349 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.92 
 
 
363 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  40.23 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  39.23 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  38.43 
 
 
384 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  41.82 
 
 
344 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>